RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR52N1Q8NH53 320 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 HAVCR1Q96D42 359 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 REEP6Q96HR9 211 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RHOVQ96L33 236 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PLK3Q9H4B4 646 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 BLOC1S6Q9UL45 172 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LAMP3Q9UQV4 416 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 USF3Q68DE3 2245 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CENPEQ02224 2701 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1W2PPW3 197 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GGT3PA6NGU5 568 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RAC2P15153 192 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBG1P23258 451 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ALDH3B1P43353 468 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 WNT4P56705 351 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 EFNB3Q15768 340 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 AGAP6Q5VW22 663 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RNLSQ5VYX0 342 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PGAP1Q75T13 922 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 COMMD2Q86X83 199 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RDH10Q8IZV5 341 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MFSD4AQ8N468 514 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5M11Q96RB7 305 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MND1Q9BWT6 205 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR84Q9NQS5 396 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CBLN4Q9NTU7 201 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ARID1AO14497 2285 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A0U1RQV5 110 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GTI1 187 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4C45A6NMZ5 311 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 B9A039 149 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OGG1O15527 345 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3-13P01766 116 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 NAT2P11245 290 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KITLGP21583 273 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CDKN1AP38936 164 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TGM4P49221 684 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SELENOVP59797 346 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM3AP98173 230 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 IKZF1Q13422 519 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TNK1Q13470 666 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SPHARQ15513 63 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MED22Q15528 200 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF773Q6PK81 442 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 Q6ZR03 302 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 DTX2Q86UW9 622 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SPARTQ8N0X7 666 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 SPSB4Q96A44 273 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 LURAP1Q96LR2 239 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 CCL19Q99731 98 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MSL2Q9HCI7 577 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 FAIMQ9NVQ4 179 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 COL12A1Q99715 3063 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 POLQO75417 2590 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.17□□□□□ -1.26
ANKRD28-208ENST00000463533 A0A1B0GVI7 797 aa7.17□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms