RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442653.1

TOP3B-209, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 3

Gene TOP3B, Length 400 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-209ENST00000442653 SPIBQ01892 262 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KRT72Q14CN4 511 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PCK2Q16822 640 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 WDR38Q5JTN6 314 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 GLYATQ6IB77 296 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 DRAM2Q6UX65 266 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 LRRC29Q8WV35 223 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 CCL13Q99616 98 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 C16orf95Q9H693 158 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SIRT7Q9NRC8 400 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ZNRD1Q9P1U0 126 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KAAG1Q9UBP8 84 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 DNAJB11Q9UBS4 358 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KPTNQ9Y664 436 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.85□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 A0A1W2PRD5 423 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 A0A1W2PRF3 423 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 A0A1W2PRM7 423 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 NDUFAB1O14561 156 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ACOT8O14734 319 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 GADD45GO95257 159 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SPARCP09486 303 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SELLP14151 372 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ZNF823P16415 610 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 EGR3Q06889 387 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 KLRD1Q13241 179 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 C11orf91Q3C1V1 193 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 WDR82Q6UXN9 313 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PNKDQ8N490 385 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 Q8N7P7 452 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SPERTQ8NA61 448 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SPSB4Q96A44 273 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 PYURFQ96I23 114 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 COPS4Q9BT78 406 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.84□□□□□ -1.31
TOP3B-209ENST00000442653 TENM3Q9P273 2699 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 G3V4G9 280 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 NPFFO15130 113 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 CCDC22O60826 627 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 TSPAN9O75954 239 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 TFF1P04155 84 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 GYPBP06028 91 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 FBP1P09467 338 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 RRM2P31350 389 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 SAA4P35542 130 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 SMIM11AP58511 58 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 FAM3AP98173 230 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 TSPAN31Q12999 210 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 IKZF1Q13422 519 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 MICBQ29980 383 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 KLHL12Q53G59 568 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 OR1M1Q8NGA1 313 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 OR2T4Q8NH00 348 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 OR8S1Q8NH09 359 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 C17orf50Q8WW18 174 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 LRTOMTQ8WZ04 291 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 TNFRSF14Q92956 283 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 SGK3Q96BR1 496 aa6.83□□□□□ -1.32
TOP3B-209ENST00000442653 KCNJ15Q99712 375 aa6.83□□□□□ -1.32
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