RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362402.1

RNU6-349P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 349, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-349P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-349P-201ENST00000362402 HERV-K104P63124 156 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 HERVK_113P63132 956 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ERVK-8P63133 956 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SKP1P63208 163 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NTHL1P78549 312 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 LCN2P80188 198 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NUCB2P80303 420 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SARNPP82979 210 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 IL9RQ01113 521 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 RUNX1Q01196 453 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 OGDHQ02218 1023 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SEMG2Q02383 582 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ACVR1Q04771 509 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CHRNB3Q05901 458 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 RAD51Q06609 339 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CYP24A1Q07973 514 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 C2orf54Q08AI8 447 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF763Q0D2J5 394 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 C2orf80Q0P641 193 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CCDC173Q0VFZ6 552 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TCP10Q12799 353 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SMARCB1Q12824 385 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 BNIP2Q12982 314 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NME3Q13232 169 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 STX3Q13277 289 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 OR2F1Q13607 317 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 APOFQ13790 326 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 COTL1Q14019 142 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 FZD2Q14332 565 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GPR176Q14439 515 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF235Q14590 738 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 LAGE3Q14657 143 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GINS1Q14691 196 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GNMTQ14749 295 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TRAM2Q15035 370 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 PDK2Q15119 407 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 PON2Q15165 354 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 RCN1Q15293 331 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TGFBIQ15582 683 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 OR4D1Q15615 310 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TRIP10Q15642 601 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TSC22D1Q15714 1073 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CHI3L2Q15782 390 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ZNF726P1Q15940 193 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GABRA6Q16445 453 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NDUFA5Q16718 116 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NDUFA9Q16795 377 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SLC25A52Q3SY17 297 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 USH1GQ495M9 461 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 PYCR3Q53H96 274 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CYBRD1Q53TN4 286 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TTMPQ5BVD1 217 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 COQ5Q5HYK3 327 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CT45A1Q5HYN5 189 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TEX30Q5JUR7 227 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 ACTL10Q5JWF8 245 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CDKL4Q5MAI5 379 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 LDLRAP1Q5SW96 308 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CLVS2Q5SYC1 327 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TPRG1LQ5T0D9 272 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CASC10Q5T4H9 136 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GPRC6AQ5T6X5 926 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 OR2G6Q5TZ20 316 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 HHATQ5VTY9 493 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 GPR107Q5VW38 600 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SAXO2Q658L1 398 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 DUPD1Q68J44 220 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TMEM225Q6GV28 225 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 C22orf42Q6IC83 251 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 OR2A2Q6IF42 318 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 REEP3Q6NUK4 255 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 NIPAL1Q6NVV3 410 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAHD1Q6P587 224 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 FAM199XQ6PEV8 388 aaPredicted RBP0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 DNM1P34Q6PK57 102 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 UQCC3Q6UW78 93 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 BTNL3Q6UXE8 466 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 CLEC18BQ6UXF7 455 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-349P-201ENST00000362402 WDR82Q6UXN9 313 aa0.16□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms