RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 BTNL8Q6UX41 500 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 OR1L3Q8NH93 324 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 SIAEQ9HAT2 523 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 COX7A2P2O60397 106 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 GSG1Q2KHT4 349 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 H3F3CQ6NXT2 135 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 LFNGQ8NES3 379 aa20.15■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 H3BMH7 237 aa20.14■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 OR2I1PQ8NGU4 316 aa20.14■□□□□ 0.82
PTPRM-201ENST00000332175 NDFIP1Q9BT67 221 aa20.14■□□□□ 0.82
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PTPRM-201ENST00000332175 ITGB4P16144 1822 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRM-201ENST00000332175 OR2G2Q8NGZ5 317 aa20.14■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa20.14■□□□□ 0.81
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PTPRM-201ENST00000332175 ZNF117Q03924 483 aa20.12■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.12■□□□□ 0.81
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PTPRM-201ENST00000332175 LAMA4Q16363 1823 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
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PTPRM-201ENST00000332175 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTSL3P82987 1691 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 PPP5D1E7EU14 171 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 GABRB1P18505 474 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 EPHA2P29317 976 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 FMODQ06828 376 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 OR2F1Q13607 317 aa20.11■□□□□ 0.81
PTPRM-201ENST00000332175 GPR32P1Q8NGA4 272 aa20.11■□□□□ 0.81
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