RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307106.3

SMIM4-201, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMIM4, Length 274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-201ENST00000307106 FAM122BQ7Z309 247 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 NRMQ8IXM6 262 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 C11orf53Q8IXP5 236 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LNX2Q8N448 690 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 LINC00482Q8N8I6 264 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 OR2AE1Q8NHA4 323 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 PITX2Q99697 317 aa9.53□□□□□ -0.88
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SMIM4-201ENST00000307106 NUAK2Q9H093 628 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.53□□□□□ -0.88
SMIM4-201ENST00000307106 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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SMIM4-201ENST00000307106 DNTTIP1Q9H147 329 aa9.52□□□□□ -0.89
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SMIM4-201ENST00000307106 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.51□□□□□ -0.89
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SMIM4-201ENST00000307106 HAO2Q9NYQ3 351 aa9.51□□□□□ -0.89
SMIM4-201ENST00000307106 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SMIM4-201ENST00000307106 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SMIM4-201ENST00000307106 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SMIM4-201ENST00000307106 TFF1P04155 84 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMIM4-201ENST00000307106 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM4-201ENST00000307106 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.5□□□□□ -0.89
SMIM4-201ENST00000307106 OR10A6Q8NH74 314 aa9.5□□□□□ -0.89
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SMIM4-201ENST00000307106 ZNF799Q96GE5 643 aa9.5□□□□□ -0.89
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