RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 KNDC1Q76NI1 1749 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CARFQ8N187 725 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ZNF441Q8N8Z8 693 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 GPX8Q8TED1 209 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 OR2W5A6NFC9 320 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 ASCL1P50553 236 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 SLC17A1Q14916 467 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CLEC2AQ6UVW9 174 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 DOT1LQ8TEK3 1739 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 IGLV3-27P01718 113 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 TMPRSS3P57727 454 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 LAX1Q8IWV1 398 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.5□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 NAV1Q8NEY1 1877 aa9.5□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 A0A1W2PN81 502 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC6A12P48065 614 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 FAM162BQ5T6X4 162 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 PP6455Q8WZ26 134 aa9.49□□□□□ -0.89
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TRPS1-201ENST00000220888 NAGKQ9UJ70 344 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 EXTL1Q92935 676 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 SYT11Q9BT88 431 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 COA4Q9NYJ1 87 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 ICAM5Q9UMF0 924 aa9.49□□□□□ -0.89
TRPS1-201ENST00000220888 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.48□□□□□ -0.89
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