RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 1810009J06RikQ9CPN7 247 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Elovl7Q9D2Y9 281 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CmipQ9D486 773 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm17087V9GXQ2 156 aa15.99■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm34653A0A1L1SR01 368 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Macc1E9PXX8 851 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Prdm13E9PZZ1 754 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il11ra1Q64385 432 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Carns1Q6ZPS2 827 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1287Q7TQY1 305 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ddhd2Q80Y98 699 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 NagpaQ8BJ48 517 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GldnQ8BMF8 549 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ldlrad4Q8BWJ4 306 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Frmd6Q8C0V9 622 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrgpra8Q91ZC4 305 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrps16Q9CPX7 135 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nckap5E9QAE1 1909 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn2r58K7N6V2 862 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Abcd4O89016 606 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Abcd3P55096 659 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spin2cQ6NVE3 257 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr884Q7TRE1 309 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr527Q7TRT9 305 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr285Q7TS17 319 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Plekhm1Q7TSI1 1074 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ip6k3Q8BWD2 396 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rcc1Q8VE37 421 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1238Q8VG59 315 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SdhbQ9CQA3 282 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Erv3Q9DAX3 200 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Calm4Q9JM83 148 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 ClnkQ9QZE2 435 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SpdefQ9WTP3 325 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn2r16E9Q025 850 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Spi1P17433 272 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cox5bP19536 128 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nat2P50295 290 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Pcbp4P57724 403 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rpl27P61358 136 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnft2Q3UF64 445 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PigtQ8BXQ2 582 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc35e4Q8K3D6 351 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr944Q9EQ91 311 aa15.98■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ralgapa1Q6GYP7 2035 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trav15d-2-dv6d-2A0A0G2JGQ7 117 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rnf217D3YYI7 515 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm16434J3QN10 205 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rag2P21784 527 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MybphlQ5FW53 355 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Kng2Q6S9I3 644 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cpeb4Q7TN98 729 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Comtd1Q8BIG7 262 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tspan9Q8BJU2 239 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Crb3Q8QZT4 113 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc39a8Q91W10 462 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Bin3Q9JI08 253 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Klrc3Q9QXN7 221 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn2r80E9Q1L0 863 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Adrb2P18762 418 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Capza2P47754 286 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 ArsbP50429 534 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cpeb1P70166 561 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc39a12Q5FWH7 689 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ptpn21Q62136 1176 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CstbQ62426 98 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lmf2Q8C3X8 702 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tspan10Q8VCF5 331 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Naa40Q8VE10 237 aa15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm12789B1AUV7 164 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r91E9PZR7 307 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm3727J3QM54 205 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GamtO35969 236 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 mt-Co3P00416 261 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mtnd4lP03903 98 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 ElocP83940 112 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Faap20Q3UN58 186 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GcsamQ6RFH4 181 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Seh1lQ8R2U0 360 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Letmd1Q924L1 360 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc2a8Q9JIF3 477 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PhyhO35386 338 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tcstv3O70518 169 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr714Q7TRN0 317 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc30a6Q8BJM5 460 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1122Q8VGT9 326 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Arpc5Q9CPW4 151 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mfsd4b2Q9D8I5 366 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Riox1Q9JJF3 603 aa15.96■□□□□ 0.15
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r82A0A087WRV1 305 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mptx2D3YYJ7 219 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm5519D3Z175 170 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr1410E9PYK6 323 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Speer4eK7N6S8 255 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tcrg-V1P06325 135 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 HckP08103 524 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fv1P70213 459 aa15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.3 ms