RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SELE	P16581	610 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CCR7	P32248	378 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	BLVRA	P53004	296 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CRISP1	P54107	249 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2M	P61081	183 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLAMF1	Q13291	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SERTAD2	Q14140	314 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TAB1	Q15750	504 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IMPG1	Q17R60	797 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2T11	Q8NH01	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MCOLN3	Q8TDD5	553 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NAT14	Q8WUY8	206 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SKA2	Q8WVK7	121 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SH3GL1	Q99961	368 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C1orf50	Q9BV19	199 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NT5DC2	Q9H857	520 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTM6	Q9NX76	183 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK11	Q9UBX7	282 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF292	O60281	2723 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GW15	77 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS12	A0PJE2	317 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GFY	I3L273	518 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MANBA	O00462	879 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR7A10	O76100	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AP2A2	O94973	939 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA4F	O95754	770 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CST4	P01036	141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MPC1L	P0DKB6	136 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG1	P11464	419 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ABO	P16442	354 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAS	P25445	335 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IL12A	P29459	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CD40LG	P29965	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NBL1	P41271	181 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GSK3B	P49841	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PDLIM4	P50479	330 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UCN	P55089	124 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2B6	P58173	313 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UBE2G2	P60604	165 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TUBA1B	P68363	451 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GNA13	Q14344	377 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	LCN8	Q6JVE9	175 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNE	Q86WN2	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HORMAD1	Q86X24	394 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DYRK2	Q92630	601 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC17A9	Q9BYT1	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DPY30	Q9C005	99 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CD84	Q9UIB8	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AP3M1	Q9Y2T2	418 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.1	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PR80	420 aa		4.1	□□□□□ -1.75

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