RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TDHQ8IZJ6 230 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 KNL1Q8NG31 2342 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4K15Q8NH41 348 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TERB2Q8NHR7 220 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 THAP6Q8TBB0 222 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CLDN23Q96B33 292 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR6C1Q96RD1 312 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CDC6Q99741 560 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 NMES1Q9C002 83 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LDAHQ9H6V9 325 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM185BQ9H7F4 350 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEC61A2Q9H9S3 476 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR84Q9NQS5 396 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GHRLQ9UBU3 117 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 WNT16Q9UBV4 365 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR160Q9UJ42 338 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GPR132Q9UNW8 380 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 POLR1DQ9Y2S0 133 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 U3KQA8 63 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 UNC13CQ8NB66 2214 aa8.5□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PNR3 127 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 A0A1W2PQM1 296 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF726A6NNF4 738 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 F8VVB4 439 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 F8VWA3 439 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TRIM77I1YAP6 450 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 K7ESF4 209 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LGALS8O00214 317 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFNGO00587 321 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 FGF16O43320 207 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CA11O75493 328 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR2J2O76002 312 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MPIG6BO95866 241 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PMP2P02689 132 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRHP06850 196 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 QDPRP09417 244 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LIPCP11150 499 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 LYL1P12980 280 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABOP16442 354 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF17P17021 662 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 IGFBP4P22692 258 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 THBS4P35443 961 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CX3CR1P49238 355 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRKXP51817 358 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ATP1B3P54709 279 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM50BP56557 158 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MFAP5Q13361 173 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF273Q14593 569 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MICBQ29980 383 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 C10orf128Q5T292 105 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PXDC1Q5TGL8 231 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF144BQ7Z419 303 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ABCA7Q8IZY2 2146 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR4K17Q8NGC6 315 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR10K1Q8NGX5 313 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 STOML3Q8TAV4 291 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 MARCH1Q8TCQ1 289 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM54Q969K7 222 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RAB3CQ96E17 227 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SEC22AQ96IW7 307 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 SCGB3A2Q96PL1 93 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 OR5B2Q96R09 309 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 RASL10BQ96S79 203 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 NICN1Q9BSH3 213 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 CRB3Q9BUF7 120 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 GAREM1Q9H706 876 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 V9GYS6 101 aa8.49□□□□□ -1.05
IGHV3-54-201ENST00000622166 BRWD1Q9NSI6 2320 aa8.48□□□□□ -1.05
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