RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601665.5

NUP62-223, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 5

Gene NUP62, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-223	ENST00000601665	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	EPGN	Q6UW88	154 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NRM	Q8IXM6	262 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	LNX2	Q8N448	690 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR8S1	Q8NH09	359 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	LRRC29	Q8WV35	223 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TNFRSF14	Q92956	283 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	PITX2	Q99697	317 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	DUX4	Q9UBX2	424 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665		U3KQK5	164 aa		9.99	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665		H0YAE9	185 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665		M0R1W7	72 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ANGPT2	O15123	496 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	CHST1	O43916	411 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	IFNA14	P01570	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ALDOB	P05062	364 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ACSM4	P0C7M7	580 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TPTE	P56180	551 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	KRTAP10-11	P60412	298 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	SELPLG	Q14242	412 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	MEP1B	Q16820	701 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	PCK2	Q16822	640 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR10A6	Q8NH74	314 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	C17orf50	Q8WW18	174 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	DDO	Q99489	341 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	CGREF1	Q99674	301 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF702P	Q9H963	129 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		9.98	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	BHLHE40	O14503	412 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ACOT8	O14734	319 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	LHB	P01229	141 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NDUFB7	P17568	137 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	LGALS4	P56470	323 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	VSNL1	P62760	191 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	HIST1H3A	P68431	136 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	KCNMB1	Q16558	191 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	VMAC	Q2NL98	169 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	HIST2H3PS2	Q5TEC6	136 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	RNF144B	Q7Z419	303 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	SPTSSA	Q969W0	71 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ZBTB9	Q96C00	473 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	ATF6B	Q99941	703 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NUAK2	Q9H093	628 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		9.97	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TENM2	Q9NT68	2774 aa		9.96	□□□□□ -0.81
NUP62-223	ENST00000601665	TMEM120B	A0PK00	339 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	SOCS2	O14508	198 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	GLCE	O94923	617 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	PAX6	P26367	422 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	CRABP1	P29762	137 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	SDHA	P31040	664 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	GPR4	P46093	362 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	GMFB	P60983	142 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	PRKCD	Q05655	676 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	NFYC	Q13952	458 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	ZBED5	Q49AG3	693 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	RABL3	Q5HYI8	236 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	CCDC80	Q76M96	950 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	RRM2B	Q7LG56	351 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	ADCK1	Q86TW2	530 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	NAA40	Q86UY6	237 aa		9.96	□□□□□ -0.82
NUP62-223	ENST00000601665	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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