RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 EMC7Q9NPA0 242 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 Q9UFV3 132 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 CLEC2DQ9UHP7 191 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PRSS50Q9UI38 385 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 LRP12Q9Y561 859 aa6.38□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.38□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 F5H5K5 113 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 RER1O15258 196 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 CX3CR1P49238 355 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 TP53I3Q53FA7 332 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 CORO6Q6QEF8 472 aa6.37□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 LRRTM2O43300 516 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 SYT7O43581 403 aa6.36□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 IGKV3-15P01624 115 aa6.36□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 LCATP04180 440 aa6.36□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 CRYGSP22914 178 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 PPP3R1P63098 170 aa6.36□□□□□ -1.39
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SMAD4-210ENST00000590061 SLC3A1Q07837 685 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 FAM209AQ5JX71 171 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 GPR107Q5VW38 600 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF774Q6NX45 483 aa6.36□□□□□ -1.39
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
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