RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553846.1

PRKCH-208, Transcript of protein kinase C eta, human

TSL 4

Gene PRKCH, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCH-208	ENST00000553846	DPP10	Q8N608	796 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OR51A7	Q8NH64	312 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CCL13	Q99616	98 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC22A4	Q9H015	551 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SYT4	Q9H2B2	425 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	EVPLL	A8MZ36	301 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CD14	P08571	375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	IFI30	P13284	250 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TAS2R41	P59536	307 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	VSNL1	P62760	191 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC35A2	P78381	396 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF92	Q03936	586 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CYP51A1	Q16850	503 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CORO6	Q6QEF8	472 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	WDR82	Q6UXN9	313 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	MICU2	Q8IYU8	434 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846		A6NDX4	124 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	FFAR1	O14842	300 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC16A7	O60669	478 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	FXYD6P3	P58550	94 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CSNK2B	P67870	215 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	MXRA7	P84157	204 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	PRKCD	Q05655	676 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	DGUOK	Q16854	277 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	VMAC	Q2NL98	169 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	PGAP1	Q75T13	922 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	DHDDS	Q86SQ9	333 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NRM	Q8IXM6	262 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	GJC3	Q8NFK1	279 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	ZNF570	Q96NI8	536 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	GAFA1	Q96PS6	74 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CGREF1	Q99674	301 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NUAK2	Q9H093	628 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NRIP3	Q9NQ35	241 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TCF19	Q9Y242	345 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846		E9PQ18	207 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TXNDC12	O95881	172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TFF1	P04155	84 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	FAH	P16930	419 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SDHA	P31040	664 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	GGT2	P36268	569 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OR1E2	P47887	323 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC9A3	P48764	834 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC18A1	P54219	525 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CAV3	P56539	151 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	IKZF1	Q13422	519 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	NFYC	Q13952	458 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	MICB	Q29980	383 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	KRT71	Q3SY84	523 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	RNF144B	Q7Z419	303 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OAF	Q86UD1	273 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	MREG	Q8N565	214 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	DTX3	Q8N9I9	347 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PRKCH-208	ENST00000553846	LRRC29	Q8WV35	223 aa		7.29	□□□□□ -1.24

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