RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOX4Q9NPH5 578 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 POU2F3Q9UKI9 436 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED12LQ86YW9 2145 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DOCK7Q96N67 2140 aa7.34□□□□□ -1.23
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.33□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WIPF3A6NGB9 483 aa7.33□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KBTBD8Q8NFY9 601 aa7.33□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.33□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SVILO95425 2214 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ICMTO60725 284 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDRT1O95170 752 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV3-1P01715 115 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UCHL1P09936 223 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF224P0DH78 156 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAHP16930 419 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRMP19623 302 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 THBS4P35443 961 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GLRXP35754 106 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MPV17P39210 176 aa7.32□□□□□ -1.24
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MXD1Q05195 221 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2T2Q6IF00 324 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAM5Q6NVV9 412 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYNPRQ8TBG9 265 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM222BQ8WU58 562 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PIGCQ92535 297 aa7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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