RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 V9GYS6 101 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0B4J203 849 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 CCL2P13500 99 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 SPOCK1Q08629 439 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 Q6ZSR3 168 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 PGAP1Q75T13 922 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 OR2AE1Q8NHA4 323 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 PALMDQ9NP74 551 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 RAB3AP20336 220 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 OPRM1P35372 400 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 GLYATL3Q5SZD4 288 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 COLCA1Q6ZS62 124 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 C17orf78Q8N4C9 275 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 NKAIN3Q8N8D7 197 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 OR1M1Q8NGA1 313 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 MS4A3Q96HJ5 214 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 LIN7BQ9HAP6 207 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 FAM25AB3EWG3 89 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 FAM25CB3EWG5 89 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 FAM25GB3EWG6 89 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 XRCC2O43543 280 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM138Q9NPI0 162 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 SPATA2Q9UM82 520 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXB3-210ENST00000489475 A0A1W2PR80 420 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 FABP12A6NFH5 140 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 BDKRB2P30411 391 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 EVX1P49640 407 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CNIH2Q6PI25 160 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 FAM131AQ6UXB0 335 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SLC30A7Q8NEW0 376 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OR13C9Q8NGT0 318 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 C10orf35Q96D05 121 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF75AQ96N20 296 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 STEAP1Q9UHE8 339 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 V9GYH0 126 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ELK1P19419 428 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CFPP27918 469 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CLDN12P56749 244 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 LY6DQ14210 128 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF529Q6P280 563 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OR5H6Q8NGV6 325 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 LGALS14Q8TCE9 139 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 DHRS7CA6NNS2 312 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SLC17A2O00624 439 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CALCBP10092 127 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 THBS4P35443 961 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 PIGMQ9H3S5 423 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 A0A0G2JNJ9 132 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 MSTNO14793 375 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SULT1B1O43704 296 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 BMP5P22003 454 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 RAB11BQ15907 218 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D28Q2M2D7 210 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 JAGN1Q8N5M9 183 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 PP6455Q8WZ26 134 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OBP2BQ9NPH6 170 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 Q9UFV3 132 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ERVH48-1M5A8F1 160 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 FAHP16930 419 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 TALDO1P37837 337 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 MAP2K3P46734 347 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF92Q03936 586 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 WDR31Q8NA23 367 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CYSLTR2Q9NS75 346 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 APOA1P02647 267 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CD37P11049 281 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CBR1P16152 277 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 IL32P24001 234 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CASP6P55212 293 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 MALLQ13021 153 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SPSB4Q96A44 273 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 SCAND1P57086 179 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 CMTM3Q96MX0 182 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 EXTL2Q9UBQ6 330 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 ETV7Q9Y603 341 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 OR5H1A6NKK0 313 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXB3-210ENST00000489475 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms