RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 MFSD9Q8NBP5 474 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 FGF14Q92915 247 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PRRT1Q99946 306 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 A0A087WUJ7 227 aa7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.1□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 UNC119Q13432 240 aa7.1□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 HCRTR1O43613 425 aa7.09□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 TXNDC12O95881 172 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.09□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 GAL3ST3Q96A11 431 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 POM121Q96HA1 1249 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 FAM3CQ92520 227 aa7.09□□□□□ -1.27
TPM3-215ENST00000469717 ERGIC1Q969X5 290 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 CHST5Q9GZS9 411 aa7.09□□□□□ -1.27
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TPM3-215ENST00000469717 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 EGR4Q05215 589 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ZP2Q05996 745 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.09□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CCL4L1Q8NHW4 92 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 MR1Q95460 341 aa7.09□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SCRT1Q9BWW7 348 aa7.09□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 FBXL17Q9UF56 701 aa7.09□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CD226Q15762 336 aa7.08□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.08□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.08□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.08□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CXCL1P09341 107 aa7.08□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CISD3P0C7P0 127 aa7.08□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SLC35G6P0C7Q6 338 aa7.08□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 GLI4P10075 376 aa7.08□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HOXA5P20719 270 aa7.08□□□□□ -1.28
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