RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFXN2Q96NB2 322 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXO5Q9H790 373 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B3GNT2Q9NY97 397 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPR179Q6PRD1 2367 aa16.46■□□□□ 0.23
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2QL1A1L167 161 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F5H5K5 113 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCGNO76038 276 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AMY2AP04746 511 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC6A9P48067 706 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IDO2Q6ZQW0 420 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FJX1Q86VR8 437 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAXDQ8IW45 347 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYZL4Q96KX0 146 aa16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC6AO75865 159 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2A4O95047 310 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F10P00742 488 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCKP08631 526 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF735P0CB33 412 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDNFQ49AH0 187 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDCP2Q5VXM1 449 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEX261Q6UWH6 196 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHMP1BQ7LBR1 199 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF101Q8IZC7 436 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST4Q8NCG5 386 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADGRG7Q96K78 797 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2A7Q96R45 310 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 U3KQ87 197 aa16.45■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PINLYPA6NC86 204 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF716A6NP11 495 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCL13O43927 109 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NTF4P34130 210 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR3A4PP47883 348 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STARP49675 285 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GSK3AP49840 483 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM27BQ5VT28 67 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2W3Q7Z3T1 314 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR4S1Q8NGB4 309 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBXO17Q96EF6 278 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RADILQ96JH8 1075 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UPB1Q9UBR1 384 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0U1RQV5 110 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GDF1P27539 372 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RAP2BP61225 183 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10R2Q8NGX6 335 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR10D3Q8NH80 312 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NICN1Q9BSH3 213 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHST6Q9GZX3 395 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LPAR5Q9H1C0 372 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC22A5O76082 557 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DLSTP36957 453 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF81P51508 661 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXO1Q12778 655 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IKZF1Q13422 519 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM104Q8NE00 496 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF680Q8NEM1 530 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ROBO4Q8WZ75 1007 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POFUT1Q9H488 388 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRFN1Q9P244 771 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCOR1O75376 2440 aa16.43■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM82A0PJX8 343 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0R135 149 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DBHP09172 617 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GNB3P16520 340 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CNR1P21554 472 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OR3A3P47888 321 aa16.42■□□□□ 0.22
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLDN15P56746 228 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms