RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 PRRG2O14669 202 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SULT1B1O43704 296 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 HPGDSO60760 199 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 IL18BPO95998 194 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 IL2RAP01589 272 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ITGA5P08648 1049 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF20P17024 532 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ADRA2CP18825 462 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 RAB3AP20336 220 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 COX5AP20674 150 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TUBG1P23258 451 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 BDKRB2P30411 391 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 GNALP38405 381 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MNDAP41218 407 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SLC6A9P48067 706 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TDGF1P3P51864 188 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 DEFA1P59665 94 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 DEFA3P59666 94 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PITPNAQ00169 270 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 RBPJQ06330 500 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 FAM189A2Q15884 450 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ODF4Q2M2E3 257 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 FAM166AQ6J272 317 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF774Q6NX45 483 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 FAM131AQ6UXB0 335 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 BEND4Q6ZU67 534 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 Q8NA96 180 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf106Q8NAJ2 232 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF671Q8TAW3 534 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SETD6Q8TBK2 473 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SPSB4Q96A44 273 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PTX4Q96A99 478 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 FGGYQ96C11 551 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TECTBQ96PL2 329 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 GFI1Q99684 422 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SRRQ9GZT4 340 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ABCG5Q9H222 651 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 BRD7Q9NPI1 651 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 GPR84Q9NQS5 396 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF224Q9NZL3 707 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PRSS50Q9UI38 385 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PROCRQ9UNN8 238 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 V9GYH0 126 aa8.54□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 A0A0A6YYH2 397 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 A6NJ64 397 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MAGEB3O15480 346 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 CGAP01215 116 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 IGHV3-9P01782 118 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MAS1P04201 325 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TPOP07202 933 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ABOP16442 354 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MAGEB1P43366 347 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MAP2K3P46734 347 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PITPNBP48739 271 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PER3P56645 1201 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 RAB1AP62820 205 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 RAB11BQ15907 218 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 GSG1Q2KHT4 349 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 RGS21Q2M5E4 152 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PYHIN1Q6K0P9 492 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 CNIH2Q6PI25 160 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 KRT74Q7RTS7 529 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SSX8Q7RTT4 187 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 LYPD6Q86Y78 171 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 OR1J2Q8NGS2 313 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 HTRA1Q92743 480 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PIGMQ9H3S5 423 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 C12orf49Q9H741 205 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF319Q9P2F9 582 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 GHRLQ9UBU3 117 aa8.53□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.52□□□□□ -1.04
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM30A4D0T7 59 aa8.52□□□□□ -1.05
POLR1A-202ENST00000409024 CTDSPLO15194 276 aa8.52□□□□□ -1.05
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