RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403915.5

KCNS3-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS3, Length 2,397 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3-202ENST00000403915 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC7A13Q8TCU3 470 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LRRN4Q8WUT4 740 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 FEVQ99581 238 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 VAMP8Q9BV40 100 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CDT1Q9H211 546 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 GREM2Q9H772 168 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 AIG1Q9NVV5 245 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 COMMD9Q9P000 198 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NPIPA1Q9UND3 350 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SCML2Q9UQR0 700 aa8.31□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 A0A087WWC5 75 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 RAMP1O60894 148 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ENTPD6O75354 484 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ATF1P18846 271 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OPRD1P41143 372 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC6A3Q01959 620 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 P2RY6Q15077 328 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TAF13Q15543 124 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 C1orf189Q5VU69 101 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 METRNLQ641Q3 311 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 C17orf64Q86WR6 236 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 GKN2Q86XP6 184 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF440Q8IYI8 595 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LINC00471Q8N535 108 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OR4K2Q8NGD2 314 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TWIST2Q8WVJ9 160 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 DNASE2BQ8WZ79 361 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PPP1R14AQ96A00 147 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PEBP4Q96S96 227 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CLMPQ9H6B4 373 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 MED20Q9H944 212 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SERTAD3Q9UJW9 196 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 MEMO1Q9Y316 297 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ODAMA1E959 279 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NME6O75414 186 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NDUFB6O95139 128 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC16A8O95907 504 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OR5H8P0DN80 308 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 UROSP10746 265 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 GABRA6Q16445 453 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CDKN3Q16667 212 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 VWA2Q5GFL6 755 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 DOK6Q6PKX4 331 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LCTLQ6UWM7 567 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LGI4Q8N135 537 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NOXO1Q8NFA2 376 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC26A10Q8NG04 563 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OR2Y1Q8NGV0 311 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 OR4X1Q8NH49 305 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ESAMQ96AP7 390 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ZNF649Q9BS31 505 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 GPR27Q9NS67 375 aa8.3□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 A8MT66 165 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CFIP05156 583 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 LINC00032P0C843 101 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SOX2P48431 317 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CSRP2Q16527 193 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 AMZ1Q400G9 498 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 ERASQ7Z444 233 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 RAX2Q96IS3 184 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 SLC39A8Q9C0K1 460 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 CORO2BQ9UQ03 480 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 RASD1Q9Y272 281 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 WDR45Q9Y484 360 aa8.29□□□□□ -1.08
KCNS3-202ENST00000403915 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms