RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 SLC37A2Q8TED4 501 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TGM7Q96PF1 710 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RAB18Q9NP72 206 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.99□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 DDTP30046 118 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SNCAP37840 140 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GRK6P43250 576 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SQSTM1Q13501 440 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR2A2Q6IF42 318 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MDGA2Q7Z553 956 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HOGA1Q86XE5 327 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM230Q96A57 120 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FBRSQ9HAH7 460 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 POLE3Q9NRF9 147 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB11Q9UBS4 358 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GABRG2P18507 467 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 AKT2P31751 481 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC17A1Q14916 467 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR4D6Q8NGJ1 314 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ST7LQ8TDW4 575 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PMM1Q92871 262 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FAM46BQ96A09 425 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SCRT1Q9BWW7 348 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PRO1933Q9H354 126 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FAM60AQ9NP50 221 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HEATR5AQ86XA9 2040 aa14.98□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TAAR5O14804 337 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR2C1O95371 312 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CST4P01036 141 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZNF616Q08AN1 781 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 UBAC2Q8NBM4 344 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OTOSQ8NHW6 89 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RSC1A1Q92681 617 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR8B4Q96RC9 309 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SMIM3Q9BZL3 60 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CYR61O00622 381 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 NKX2-2O95096 273 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GPR75O95800 540 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HKR1P10072 659 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 NPY4RP50391 375 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RSU1Q15404 277 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TAF8Q7Z7C8 310 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR52R1Q8NGF1 315 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HIF3AQ9Y2N7 669 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A087X0M5 115 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 A0A1B0GX30 115 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 BTBD17A6NE02 478 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SEMA4FO95754 770 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DQA2P01906 255 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PET100P0DJ07 73 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 GNB3P16520 340 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FDX2Q6P4F2 183 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CLEC9AQ6UXN8 241 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 FBXL17Q9UF56 701 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CD207Q9UJ71 328 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 B9D1Q9UPM9 204 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SPACA6W5XKT8 324 aa14.97□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SFT2D2O95562 160 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SPCS3P61009 180 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 RAP1AP62834 184 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 MGAT2Q10469 447 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 CA13Q8N1Q1 262 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 YPEL4Q96NS1 127 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TSPAN32Q96QS1 320 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
GDE1-201ENST00000353258 HSPB2A8KAH6 182 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 TNFRSF10CO14798 259 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 PSG6Q00889 435 aa14.96□□□□□ -0.02
GDE1-201ENST00000353258 HSPB2Q16082 182 aa14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms