RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SNX3O60493 162 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 KRT36O76013 467 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 TOX4O94842 621 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 LIPFP07098 398 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 GRPP07492 148 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 SPARCP09486 303 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 SLC2A1P11166 492 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 HMGA2P52926 109 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 Q6YL49 198 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF826PQ6ZT77 177 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 LNX2Q8N448 690 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 SPERTQ8NA61 448 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 SLC37A3Q8NCC5 494 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 RASSF4Q9H2L5 321 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 SMURF1Q9HCE7 757 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM36Q9NQ86 728 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 CENPMQ9NSP4 180 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 IL20Q9NYY1 176 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.27■□□□□ 0.2
CXCL3-201ENST00000296026 OOEPA6NGQ2 149 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 A6NLC8 198 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TNFRSF11BO00300 401 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 NDUFA2O43678 99 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CRYBA1P05813 215 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 MMP9P14780 707 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TAF13Q15543 124 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 LINC00471Q8N535 108 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SLAMF6Q96DU3 332 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 WDFY2Q96P53 400 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TBX15Q96SF7 602 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 KCNJ15Q99712 375 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D23Q9NUY8 699 aa16.26■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GUS0 222 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 GASTP01350 101 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 GYPAP02724 150 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 GYPBP06028 91 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 FMO3P31513 532 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ENTPD1P49961 510 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CRMP1Q14194 572 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CPLX4Q7Z7G2 160 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 GCSAMQ8N6F7 178 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF511Q8NB15 262 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CHIAQ9BZP6 476 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM15Q9C019 465 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 OPA3Q9H6K4 179 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 C14orf119Q9NWQ9 140 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.25■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF878C9JN71 531 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 XRCC2O43543 280 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 KNG1P01042 644 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 MELTFP08582 738 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 RAG2P55895 527 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 MZT1Q08AG7 82 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 PCK2Q16822 640 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 METTL11BQ5VVY1 283 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 FAM90A1Q86YD7 464 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB107AQ8IZN7 70 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 KIR3DL3Q8N743 410 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 OR4F5Q8NH21 305 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 GATAD2BQ8WXI9 593 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TSSK6Q9BXA6 273 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SIRPDQ9H106 197 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 BEX1Q9HBH7 125 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.24■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 DVL1O14640 695 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TBX1O43435 398 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 FCN3O75636 299 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CCNB2O95067 398 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 LHBP01229 141 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SPI1P17947 270 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 RELBQ01201 579 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 POU4F2Q12837 409 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 PDCD1Q15116 288 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SPATS1Q496A3 300 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TEX30Q5JUR7 227 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 C16orf89Q6UX73 402 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 CYP2R1Q6VVX0 501 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 BTN2A1Q7KYR7 527 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM86BQ8N661 226 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 OR6K6Q8NGW6 343 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 OR8S1Q8NH09 359 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 WFDC12Q8WWY7 111 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 LHX4Q969G2 390 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 SPSB4Q96A44 273 aa16.23■□□□□ 0.19
CXCL3-201ENST00000296026 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms