RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295645.8

PDCL2-201, Transcript of phosducin like 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL2, Length 861 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2-201ENST00000295645 ALKBH6Q3KRA9 238 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 C9orf135Q5VTT2 229 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SLC16A14Q7RTX9 510 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CDH26Q8IXH8 852 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 OR52E2Q8NGJ4 325 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 APH1BQ8WW43 257 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CSPG4P5Q96PW8 444 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 TMEM106BQ9NUM4 274 aa1.23□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 XKRY2A2RUG3 117 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 LYRM9A8MSI8 78 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 GOLGA8NF8WBI6 632 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 H0Y8G0 127 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 LSM1O15116 133 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 RAD51CO43502 376 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 SCO1O75880 301 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 SULT1E1P49888 294 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 RPS23P62266 143 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CYP24A1Q07973 514 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 DGCR6Q14129 220 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 CERS6Q6ZMG9 384 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 CBLN2Q8IUK8 224 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 OR2Z1Q8NG97 314 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 OR7G2Q8NG99 324 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 OR51E1Q8TCB6 317 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 MARVELD1Q9BSK0 173 aa1.22□□□□□ -2.21
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PDCL2-201ENST00000295645 PTTG3PQ9NZH4 202 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 HPCAL4Q9UM19 191 aa1.22□□□□□ -2.21
PDCL2-201ENST00000295645 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SMCO3A2RU48 225 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SIRPB1O00241 398 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 GABRPO00591 440 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 AQP9O43315 295 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 NMT2O60551 498 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 CIB2O75838 187 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 CT45A6P0DMU7 189 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 CT45A5P0DMU8 189 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 CT45A7P0DMV0 189 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 BMI1P35226 326 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 ACOT2P49753 483 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 RAB7AP51149 207 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 NDUFA8P51970 172 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 TAS2R46P59540 309 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 RAB10P61026 200 aa1.21□□□□□ -2.22
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PDCL2-201ENST00000295645 LUZP6Q538Z0 58 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 CT45A1Q5HYN5 189 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 C22orf42Q6IC83 251 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 ZYG11AQ6WRX3 759 aa1.21□□□□□ -2.22
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PDCL2-201ENST00000295645 CT45A3Q8NHU0 189 aa1.21□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.21□□□□□ -2.22
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PDCL2-201ENST00000295645 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa1.21□□□□□ -2.22
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PDCL2-201ENST00000295645 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SDHAF1A6NFY7 115 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 PDZK1P1A8MUH7 402 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 C15orf65H3BRN8 121 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SERPINB7O75635 380 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 AQP8O94778 261 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 SNX4O95219 450 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 FTH1P02794 183 aa1.2□□□□□ -2.22
PDCL2-201ENST00000295645 MT-ND4P03905 459 aa1.2□□□□□ -2.22
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