RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000056925.15

Col6a3-201, Transcript of Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Col6a3, Length 10,106 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 TazI7HJS2 263 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 VipP32648 170 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1167Q7TR26 316 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1170Q8VFG1 316 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr38Q8VGP4 317 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Plpp7Q91WB2 271 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr101Q920Z0 308 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Igh-1aP01865 398 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Otx2P80206 289 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cd84Q18PI6 329 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tex30Q3TUU5 225 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1211Q7TR09 311 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr335-psQ7TRY6 312 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Znf768Q8R0T2 568 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pfn4Q9D6I3 129 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Herpud2Q9JJC9 404 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Adamts5Q9R001 930 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Zfp979A2A799 407 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Sft2d1Q5SSN7 159 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1135Q7TR42 310 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Abhd3Q91ZH7 411 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ceacam2Q925P2 520 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 HrgQ9ESB3 525 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 HraslsQ9QZU4 167 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ms4a18J3QN01 344 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rab22aP35285 194 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Klf1P46099 358 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Fam221aQ8C790 301 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PigcQ9CXR4 297 aa9.6□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Sdc1P18828 311 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Ccr5P51682 354 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Plp1P60202 277 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PimregQ8BFY7 231 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cpt1cQ8BGD5 798 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mblac2Q8BL86 279 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Foxn4Q8K3Q3 521 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pdzd3Q99MJ6 498 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Vmn1r52Q9EP79 309 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 AllcQ9JHX6 414 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Vmn1r142K7N6U0 305 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Fbxw15L7N1X6 466 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm3512L7N206 146 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pde6dO55057 150 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Hsd3b3P26150 373 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tbx6P70327 436 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Zp3rQ60736 579 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cldn34b3Q80ZS5 209 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Fbxw13Q8BI57 466 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1491Q8VEZ5 319 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1132Q8VG97 308 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pofut1Q91ZW2 393 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Dmac2Q9D7K5 258 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Qser1A2BIE1 1698 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 H2-T23P06339 357 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Nid1P10493 1245 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Wnt6P22727 364 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 CebpbP28033 296 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Zp1Q62005 623 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Psat1Q99K85 370 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Akirin1Q99LF1 191 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Rpp14Q9CQH8 122 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Lat2Q9JHL0 203 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pus1Q9WU56 423 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Sipa1l1Q8C0T5 1782 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Defa35E9QLQ1 93 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gm17535J3KMR8 224 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 P01878 344 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Htr7P32304 448 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 LepP41160 167 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Nhlh1Q02576 133 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Upk3bQ80YF6 275 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Enpp5Q9EQG7 477 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Chst11Q9JME2 352 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Fbp1Q9QXD6 338 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Syngr4Q9Z1L2 233 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mamdc4A2AJA7 1228 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr568E9Q554 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Gp1baO35930 734 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr141Q60880 325 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr1111Q7TR55 312 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr193Q7TS43 309 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Lair1Q8BG84 263 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Cmtm4Q8CJ61 208 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 PhyhipQ8K0S0 330 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr790Q8VGJ3 322 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Vmn1r44Q9EQ47 310 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr894Q9EQB2 313 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Mmp27D3YV89 551 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Lgals3P16110 264 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Jmjd8Q3TA59 316 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Tacstd2Q8BGV3 317 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Slc25a42Q8R0Y8 318 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Dusp7Q91Z46 422 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Kiaa1324A2AFS3 1009 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Vmn1r5B2RQT2 315 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Olfr746E9Q840 314 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Pwwp2bE9Q9M8 600 aa9.59□□□□□ -0.87
Col6a3-201ENSMUST00000056925 Akain1G3UWD5 69 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms