RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spin2cQ6NVE3 257 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tas2r113Q7M711 309 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1106Q7TR57 312 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl27Q8BGM4 238 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r72Q8K3N7 306 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ApehQ8R146 732 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr780Q8VEU0 312 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gje1Q9CX92 205 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc167Q9D162 97 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 EurlQ9D7G4 290 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gstk1Q9DCM2 226 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl6Q9QXW0 535 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gk2Q9WU65 554 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr545Q9WU94 316 aa11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AcacaQ5SWU9 2345 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sult6b2B7ZWN4 290 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Btbd8D3YUB6 377 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr66F8VQ01 311 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Speer4eK7N6S8 255 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igsf6P0C6B7 237 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RptnP97347 1118 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf133Q14B02 382 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adgrg5Q3V3Z3 524 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zp3rQ60736 579 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr10Q60883 311 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr151Q60893 309 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyb561a3Q6P1H1 242 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tfap2eQ6VUP9 442 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SetmarQ80UJ9 309 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam98bQ80VD1 429 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acp7Q8BX37 438 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nectin4Q8R007 508 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spef1Q99JL1 234 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gabra4Q9D6F4 552 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ca13Q9D6N1 262 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RetnlaQ9EP95 111 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scamp2Q9ERN0 329 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Calm4Q9JM83 148 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc20bD3Z3I0 519 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpig6bD7PDD4 242 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh19E9Q3A7 770 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr173E9QAT7 321 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm8050L7N2E3 205 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abcd4O89016 606 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Agtr1aP29754 359 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fthl17dQ3SXD1 176 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mtcp1Q60945 107 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zc4h2Q68FG0 224 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp748Q7TPL6 888 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rxfp3Q8BGE9 472 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nars2Q8BGV0 477 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap3s2Q8BSZ2 193 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Frmd6Q8C0V9 622 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo4Q8CHQ0 385 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35e4Q8K3D6 351 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Srpx2Q8R054 468 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35a3Q8R1T4 326 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r17Q8R2D8 303 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1110Q8VG38 312 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1395Q8VGD7 317 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fthl17Q99MX2 176 aa11.35□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-43A0A0A6YXN5 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv1-42A0A0A6YY38 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1082A0A1L1SUC9 313 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1205A2ATJ7 307 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr547E9PXN3 311 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P18524 117 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mst1P26928 716 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LumP51885 338 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GifP52787 417 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hrh3P58406 445 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rap2bP61226 183 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alg11Q3TZM9 492 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Taar6Q5QD13 345 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2j2Q6P073 259 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adam20Q7M763 760 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr429Q7TRW1 312 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddhd2Q80Y98 699 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxl2Q8BH16 423 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Comtd1Q8BIG7 262 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam25cQ8CF02 89 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tysnd1Q9DBA6 568 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem176aQ9DCS1 244 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bin3Q9JI08 253 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl39Q9JKF7 336 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a5Q9Z0E8 557 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc11A2A5H7 82 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C2cd6E9Q152 557 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bnip2O54940 326 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl18P35980 188 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1222Q7TR02 311 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35f4Q8BZK4 485 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LaynQ8C351 381 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rft1Q8C3B8 541 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r228Q8R2A7 333 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ocel1Q8VCR9 219 aa11.34□□□□□ -0.59
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tinagl1Q99JR5 466 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 50.1 ms