Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ap3s2Q8BSZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ap3s2Q8BSZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ap3s2Q8BSZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap3s2Q8BSZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Ap3s2Q8BSZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ap3s2Q8BSZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ap3s2Q8BSZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ap3s2Q8BSZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ap3s2Q8BSZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ap3s2Q8BSZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ap3s2Q8BSZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ap3s2Q8BSZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ap3s2Q8BSZ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ap3s2Q8BSZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ap3s2Q8BSZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ap3s2Q8BSZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ap3s2Q8BSZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ap3s2Q8BSZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ap3s2Q8BSZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ap3s2Q8BSZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ap3s2Q8BSZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ap3s2Q8BSZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3s2Q8BSZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Ap3s2Q8BSZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ap3s2Q8BSZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ap3s2Q8BSZ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ap3s2Q8BSZ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ap3s2Q8BSZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ap3s2Q8BSZ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ap3s2Q8BSZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ap3s2Q8BSZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ap3s2Q8BSZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ap3s2Q8BSZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ap3s2Q8BSZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3s2Q8BSZ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ap3s2Q8BSZ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ap3s2Q8BSZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ap3s2Q8BSZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ap3s2Q8BSZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ap3s2Q8BSZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ap3s2Q8BSZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ap3s2Q8BSZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ap3s2Q8BSZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ap3s2Q8BSZ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3s2Q8BSZ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3s2Q8BSZ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ap3s2Q8BSZ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3s2Q8BSZ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3s2Q8BSZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ap3s2Q8BSZ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ap3s2Q8BSZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ap3s2Q8BSZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3s2Q8BSZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3s2Q8BSZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3s2Q8BSZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3s2Q8BSZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ap3s2Q8BSZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3s2Q8BSZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3s2Q8BSZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ap3s2Q8BSZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ap3s2Q8BSZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3s2Q8BSZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3s2Q8BSZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ap3s2Q8BSZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3s2Q8BSZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3s2Q8BSZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ap3s2Q8BSZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ap3s2Q8BSZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms