Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ap3s2Q8BSZ2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,92■■■□□ 2,22
Ap3s2Q8BSZ2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
Ap3s2Q8BSZ2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Ap3s2Q8BSZ2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,2■■■□□ 2,11
Ap3s2Q8BSZ2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC27,93■■■□□ 2,06
Ap3s2Q8BSZ2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ap3s2Q8BSZ2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ap3s2Q8BSZ2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ap3s2Q8BSZ2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ap3s2Q8BSZ2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ap3s2Q8BSZ2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Ap3s2Q8BSZ2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Ap3s2Q8BSZ2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ap3s2Q8BSZ2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ap3s2Q8BSZ2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Ap3s2Q8BSZ2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Ap3s2Q8BSZ2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,64■■□□□ 1,69
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25,57■■□□□ 1,68
Ap3s2Q8BSZ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ap3s2Q8BSZ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ap3s2Q8BSZ2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ap3s2Q8BSZ2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,34■■□□□ 1,65
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ap3s2Q8BSZ2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,25■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ap3s2Q8BSZ2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ap3s2Q8BSZ2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ap3s2Q8BSZ2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap3s2Q8BSZ2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25,14■■□□□ 1,62
Ap3s2Q8BSZ2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ap3s2Q8BSZ2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ap3s2Q8BSZ2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ap3s2Q8BSZ2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ap3s2Q8BSZ2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ap3s2Q8BSZ2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ap3s2Q8BSZ2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ap3s2Q8BSZ2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,59
Ap3s2Q8BSZ2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Ap3s2Q8BSZ2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Ap3s2Q8BSZ2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ap3s2Q8BSZ2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Ap3s2Q8BSZ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Ap3s2Q8BSZ2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,57■■□□□ 1,52
Ap3s2Q8BSZ2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Ap3s2Q8BSZ2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Ap3s2Q8BSZ2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Ap3s2Q8BSZ2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Ap3s2Q8BSZ2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,39■■□□□ 1,5
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
Ap3s2Q8BSZ2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Ap3s2Q8BSZ2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ap3s2Q8BSZ2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
Ap3s2Q8BSZ2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
Ap3s2Q8BSZ2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Ap3s2Q8BSZ2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
Ap3s2Q8BSZ2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24,19■■□□□ 1,46
Ap3s2Q8BSZ2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24,15■■□□□ 1,46
Ap3s2Q8BSZ2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Ap3s2Q8BSZ2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Ap3s2Q8BSZ2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Ap3s2Q8BSZ2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Ap3s2Q8BSZ2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ap3s2Q8BSZ2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Ap3s2Q8BSZ2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ap3s2Q8BSZ2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Ap3s2Q8BSZ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ap3s2Q8BSZ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ap3s2Q8BSZ2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ap3s2Q8BSZ2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,81■■□□□ 1,4
Ap3s2Q8BSZ2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ap3s2Q8BSZ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ap3s2Q8BSZ2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ap3s2Q8BSZ2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,77■■□□□ 1,4
Ap3s2Q8BSZ2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ap3s2Q8BSZ2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ap3s2Q8BSZ2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ap3s2Q8BSZ2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Ap3s2Q8BSZ2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Ap3s2Q8BSZ2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ap3s2Q8BSZ2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,1 ms