RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, human

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMS1-222	ENST00000639501	CLPS	P04118	112 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	RD3L	P0DJH9	198 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	HPGD	P15428	266 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	CCIN	Q13939	588 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	OR52N5	Q8NH56	324 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF519	Q8TB69	540 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	DGAT2	Q96PD7	388 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PMS1-222	ENST00000639501	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		18.27	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PLRG1	O43660	514 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SEC13	P55735	322 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	AWAT1	Q58HT5	328 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF321P	Q8N8H1	164 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	OR4K15	Q8NH41	348 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PCOLCE2	Q9UKZ9	415 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501		R4GMQ9	66 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	MEGF11	A6BM72	1044 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF264	O43296	627 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	IGHV2-5	P01817	119 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	NQO2	P16083	231 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ACKR3	P25106	362 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	AWAT2	Q6E213	333 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	CDC6	Q99741	560 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	FGGY	Q96C11	551 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF217	O75362	1048 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	S100A10	P60903	97 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	BIK	Q13323	160 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	OR2A2	Q6IF42	318 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501		Q6ZRG5	221 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501		A0A0A6YYD4	124 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	EPOP	A6NHQ4	379 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SFT2D2	O95562	160 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	TAS2R31	P59538	309 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZC3HAV1	Q7Z2W4	902 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PRR22	Q8IZ63	422 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF561	Q8N587	486 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	METTL27	Q8N6F8	245 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	TERB2	Q8NHR7	220 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	GPR132	Q9UNW8	380 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501		A0A0J9YY10	115 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	C2orf74	A8MZ97	194 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	MT-ND4L	P03901	98 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SULT1A2	P50226	295 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	RAB30	Q15771	203 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	RNF212	Q495C1	297 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SPACA5	Q96QH8	159 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	S1PR5	Q9H228	398 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	RAB18	Q9NP72	206 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SCD	O00767	359 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	UTS2	O95399	124 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	S100P	P25815	95 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF117	Q03924	483 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	FUT7	Q11130	342 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	COX15	Q7KZN9	410 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	GKN2	Q86XP6	184 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	FOXQ1	Q9C009	403 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ADAM19	Q9H013	955 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	C7orf77	A4D0Y5	90 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	GNAL	P38405	381 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	SPEM2	Q0P670	501 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PMS1-222	ENST00000639501	POC1A	Q8NBT0	407 aa		18.23	■□□□□ 0.51

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms