RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.96□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa8.96□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FREM1Q5H8C1 2179 aa8.96□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAJC13O75165 2243 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 NEURL1O76050 574 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FSTP19883 344 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 IL32P24001 234 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GDF1P27539 372 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 RAD52P43351 418 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DYRK1AQ13627 763 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF813Q6ZN06 617 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF627Q7L945 461 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LIX1LQ8IVB5 337 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACBD4Q8NC06 268 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR8S1Q8NH09 359 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM54Q969K7 222 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF292O60281 2723 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CCDC187A0A096LP49 1063 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 F5H5K5 113 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ICAM2P13598 275 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRD5A2P31213 254 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 HACD4Q5VWC8 232 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBXO17Q96EF6 278 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 MED30Q96HR3 178 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LYZL4Q96KX0 146 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SFXN2Q96NB2 322 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 GON7Q9BXV9 100 aa8.95□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ACOT7O00154 380 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALX3O95076 343 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-9P01782 118 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CARD18P57730 90 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRYQ05066 204 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 UNC119Q13432 240 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A25Q6KCM7 469 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNM1P46Q6ZS02 220 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC38A6Q8IZM9 456 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF283Q8N7M2 679 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR10D3Q8NH80 312 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ABHD3Q8WU67 409 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOXL4Q96JB6 756 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AIFM2Q9BRQ8 373 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZPBPQ9BS86 351 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CA10Q9NS85 328 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 AKAP13Q12802 2813 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM186AA6NE01 2351 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FAM166BA8MTA8 275 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 LDLRAD4O15165 306 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SULT1B1O43704 296 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF806P0C7X5 589 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITGA3P26006 1051 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFPP27918 469 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CBX5P45973 191 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSRP2Q16527 193 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 KCNMB1Q16558 191 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR4C16Q8NGL9 310 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR56B4Q8NH76 319 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 HYLS1Q96M11 299 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.94□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1W2PP11 408 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF716A6NP11 495 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 G3V3Q6 166 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 H7C417 338 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DHHO43323 396 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD3DP04234 171 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ITGB2P05107 769 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 CD37P11049 281 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANXA3P12429 323 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 DCAF10Q5QP82 559 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5AS1Q8N127 324 aa8.93□□□□□ -0.98
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms