RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 LIX1LQ8IVB5 337 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASB5Q8WWX0 329 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC120Q96HB5 630 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10A2Q9H208 303 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPR84Q9NQS5 396 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 LOC100509620A0A075B734 347 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ANKRD61A6NGH8 418 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 NCR1O76036 304 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TPRA1Q86W33 373 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MCFD2Q8NI22 146 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A46Q96AG3 418 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLITRK2Q9H156 845 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C5orf63A6NC05 138 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QL1O75973 258 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLPXO76031 633 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 AGFG2O95081 481 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAF1P04049 648 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB3BP20337 219 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF404Q494X3 552 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf78Q8N4C9 275 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 BOD1Q96IK1 185 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 JKAMPQ9P055 326 aa14.97□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A0U1RQV5 110 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 A0A1B0GTI1 187 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 LMX1BO60663 402 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERPINA5P05154 406 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 STAC2Q6ZMT1 411 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 DOK3Q7L591 496 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR31Q8NA23 367 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC30A7Q8NEW0 376 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGGYQ96C11 551 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 SOX7Q9BT81 388 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa14.96□□□□□ -0.01
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 A6NIN4 97 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDCD5O14737 125 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAS1P04201 325 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNALP38405 381 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 LSAMPQ13449 338 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CKLFQ9UBR5 152 aa14.96□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5H1A6NKK0 313 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CELA3BP08861 270 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CBR1P16152 277 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF12P17014 697 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF20P17024 532 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR10A3P58181 314 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM27E3Q08E93 113 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SGK3Q96BR1 496 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 S100PBPQ96BU1 408 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 REEP6Q96HR9 211 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 LYZL4Q96KX0 146 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF75AQ96N20 296 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CFAP46Q8IYW2 2715 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASCL1P50553 236 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 STEAP2Q8NFT2 490 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMP27Q9H306 513 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 OBP2BQ9NPH6 170 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAS2R4Q9NYW5 299 aa14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CCL1P22362 96 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP78Q5JTW2 689 aa14.93□□□□□ -0.02
USP3-AS1-201ENST00000558831 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.3 ms