RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558040.5

SNX1-203, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 5

Gene SNX1, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-203ENST00000558040 SLC22A1O15245 554 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SYT7O43581 403 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OCM2P0CE71 109 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NR4A1P22736 598 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MALLQ13021 153 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CTF1Q16619 201 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 Q499Y3 187 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 DOK3Q7L591 496 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 RDH10Q8IZV5 341 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR13C5Q8NGS8 318 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 KCNS3Q9BQ31 491 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GPR84Q9NQS5 396 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TBCCD1Q9NVR7 557 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 DHDHQ9UQ10 334 aa14.61□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ICMTO60725 284 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 SC5DO75845 299 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ARL6IP5O75915 188 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CD2P06729 351 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CCL1P22362 96 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PCSK6P29122 969 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 LSM3P62310 102 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 FOXB2Q5VYV0 432 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 WFDC8Q8IUA0 241 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 REEP6Q96HR9 211 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 KCTD7Q96MP8 289 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR14A2Q96R54 314 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CENPOQ9BU64 300 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OPA3Q9H6K4 179 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.6□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 H3BMQ9 156 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ATE1O95260 518 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 IGLV3-1P01715 115 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CRYAAP02489 173 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 RAF1P04049 648 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZNF35P13682 527 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PEX19P40855 299 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 WNT5AP41221 380 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 VBP1P61758 197 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NAAAQ02083 359 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 CDSNQ15517 529 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 C22orf42Q6IC83 251 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 KBTBD8Q8NFY9 601 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ITFG2Q969R8 447 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 NPAP1Q9NZP6 1156 aa14.59□□□□□ -0.07
SNX1-203ENST00000558040 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 A0A1B0GTI1 187 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 TUBG1P23258 451 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 MYL9P24844 172 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 RAD52P43351 418 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 SOX2P48431 317 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 NCS1P62166 190 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 TFF3Q07654 80 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 INSL4Q14641 139 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 USP43Q70EL4 1123 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 PLPP7Q8NBV4 271 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 TMEM106AQ96A25 262 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 SPSB4Q96A44 273 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 SGK3Q96BR1 496 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 DERL3Q96Q80 235 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 SPEF1Q9Y4P9 236 aa14.58□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 C5orf63A6NC05 138 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 H3BSH0 61 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 SMPD2O60906 423 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 DHRS3O75911 302 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 THBDP07204 575 aa14.57□□□□□ -0.08
SNX1-203ENST00000558040 UCHL1P09936 223 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.4 ms