RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554118.1

LRP1-206, Transcript of LDL receptor related protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene LRP1, Length 418 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1-206ENST00000554118 LCATP04180 440 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 CD3EP07766 207 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RPSAP08865 295 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ACSM4P0C7M7 580 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SLC2A1P11166 492 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RGS6P49758 472 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 NR1H2P55055 460 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 WNT4P56705 351 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 DEFA6Q01524 100 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 BSPH1Q075Z2 132 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 IRF3Q14653 427 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MED22Q15528 200 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 LIPNQ5VXI9 398 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 KLBQ86Z14 1044 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 EGFL6Q8IUX8 553 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SPARTQ8N0X7 666 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PELI1Q96FA3 418 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RADILQ96JH8 1075 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 C4orf45Q96LM5 186 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 OR51B6Q9H340 312 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 VCX3AQ9NNX9 186 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 BRD7Q9NPI1 651 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 R4GMQ9 66 aa6.7□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.341e-6■□□□□ 9.4
LRP1-206ENST00000554118 DPRXA6NFQ7 191 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ABCD4O14678 606 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TBX1O43435 398 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 CTAG2O75638 210 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RAF1P04049 648 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ZNF35P13682 527 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ATP6V1B1P15313 513 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 CALCRP30988 508 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PSMB10P40306 273 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MAP2K4P45985 399 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MMP16P51512 607 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TAS2R43P59537 309 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 HGFACQ04756 655 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SPOCK1Q08629 439 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SPHARQ15513 63 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SHEQ5VZ18 495 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SLC22A25Q6T423 547 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 FAM57BQ71RH2 274 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 OR52H1Q8NGJ2 320 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ABHD4Q8TB40 342 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 FCGR1BQ92637 280 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RORBQ92753 470 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PGAM5Q96HS1 289 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 COG8Q96MW5 612 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 OR10A2Q9H208 303 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TBCCD1Q9NVR7 557 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 FAM206AQ9NX38 181 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 OR52A1Q9UKL2 312 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.69□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ACOD1A6NK06 481 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 E9PI62 339 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 J3QW42 95 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ICMTO60725 284 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SMPD2O60906 423 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 GOSR1O95249 250 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 ATE1O95260 518 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 PNPP00491 289 aa6.68□□□□□ -1.34
LRP1-206ENST00000554118 LCKP06239 509 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms