RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PLET1Q6UQ28 207 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 WDR31Q8NA23 367 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MDS2Q8NDY4 140 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR11H7Q8NGC8 314 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TMEM158Q8WZ71 300 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CHAC1Q9BUX1 264 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PDFQ9HBH1 243 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 V9GYY9 64 aa3.51□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 A6NDX4 124 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CD5LO43866 347 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF861PO60384 105 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HLA-DPB1P04440 258 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ADRB3P13945 408 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TCN2P20062 427 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 UBE2E1P51965 193 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TAS2R60P59551 318 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MPPED2Q15777 294 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 NDUFAF7Q7L592 441 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 METTL13Q8N6R0 699 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 COX18Q8N8Q8 333 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 Q8N9W7 124 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR10Z1Q8NGY1 313 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 FAM104AQ969W3 186 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OSBPL11Q9BXB4 747 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 VCX3AQ9NNX9 186 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TREX1Q9NSU2 369 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLC17A7Q9P2U7 560 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GMEB1Q9Y692 573 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PALLDQ8WX93 1383 aa3.5□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ASTN1O14525 1302 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MAP3K19Q56UN5 1328 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ATRXP46100 2492 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 A0A0A6YYD5 115 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PANO1I0J062 215 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CTNSO60931 367 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RP2O75695 350 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SEMA3DO95025 777 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GABARAPO95166 117 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CD37P11049 281 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PRPS2P11908 318 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LOXP28300 417 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HOXA9P31269 272 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DEKP35659 375 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SPAM1P38567 509 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 UBE2AP49459 152 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SYNJ2BPP57105 145 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PAFAH1B2P68402 229 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ARG2P78540 354 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ST3GAL4Q11206 333 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 GPR176Q14439 515 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ORMDL2Q53FV1 153 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 AVPI1Q5T686 147 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CPTPQ5TA50 214 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RAB43Q86YS6 212 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PCP2Q8IVA1 136 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 Q8N976 141 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ABHD3Q8WU67 409 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RNF138Q8WVD3 245 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 HAUS1Q96CS2 278 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF229Q9UJW7 825 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa3.49□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 LRP4O75096 1905 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 DFFAO00273 331 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 RTL8CO15255 209 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 CA11O75493 328 aa3.48□□□□□ -1.85
USP15-218ENST00000552346 SLC25A27O95847 323 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms