RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551009.5

ATP2B1-208, Transcript of ATPase plasma membrane Ca2+ transporting 1, human

TSL 3

Gene ATP2B1, Length 943 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP2B1-208	ENST00000551009	AQP8	O94778	261 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RAB3D	O95716	219 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SNAP29	O95721	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RAB36	O95755	333 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	PVR	P15151	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF250	P15622	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ATF6	P18850	670 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RAB4A	P20338	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZP3	P21754	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	GCK	P35557	465 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	COIL	P38432	576 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	KIR3DL2	P43630	455 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	GSS	P48637	474 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	HMGCS1	Q01581	520 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	CYP24A1	Q07973	514 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SLC39A6	Q13433	755 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NAB1	Q13506	487 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ASAH1	Q13510	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SPOPL	Q6IQ16	392 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	WDR31	Q8NA23	367 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR2L5	Q8NG80	312 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR56B4	Q8NH76	319 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ACTL9	Q8TC94	416 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	EEF1AKMT3	Q96AZ1	226 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	WDR34	Q96EX3	536 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RILP	Q96NA2	401 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	HBEGF	Q99075	208 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	C12orf10	Q9HB07	376 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DUX4	Q9UBX2	424 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	MLX	Q9UH92	298 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RICTOR	Q6R327	1708 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NCOA1	Q15788	1441 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	KIAA0232	Q92628	1395 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009		A6NDN8	102 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SHISA9	B4DS77	424 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009		C9J4A7	227 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009		M0QZ92	97 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ACOX3	O15254	700 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	GCG	P01275	180 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	IGKV3-15	P01624	115 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ARL2	P36404	184 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	SERPINB8	P50452	374 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RHOA	P61586	193 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	CCL7	P80098	99 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	MGAT3	Q09327	533 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	STX4	Q12846	297 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RAB31	Q13636	194 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	RFX4	Q33E94	735 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ZBED5	Q49AG3	693 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	DRAM2	Q6UX65	266 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	PEX26	Q7Z412	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.54	□□□□□ -1.84
ATP2B1-208	ENST00000551009	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		3.54	□□□□□ -1.84

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