RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TSPAN19P0C672 248 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 RAP2AP10114 183 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CLK1P49759 484 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PSG4Q00888 419 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ST3GAL3Q11203 375 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GUSBP1Q15486 140 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TAF13Q15543 124 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IFI44LQ53G44 452 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 RNF138Q8WVD3 245 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 FCGR1BQ92637 280 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MMP26Q9NRE1 261 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GLRX2Q9NS18 164 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SCN3BQ9NY72 215 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 A4GNTQ9UNA3 340 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 LINC00862A6NCI5 91 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 F5H5P2 479 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MT-ND2P03891 347 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 H1F0P07305 194 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CD36P16671 472 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 STOMP27105 288 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 MAP2K4P45985 399 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLC15A1P46059 708 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 SLC35A2P78381 396 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ECH1Q13011 328 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TMEM81Q6P7N7 255 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 IL4I1Q96RQ9 567 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 POFUT1Q9H488 388 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 AUP1Q9Y679 476 aa6.46□□□□□ -1.37
CS-212ENST00000548567 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 MEIOCA2RUB1 952 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 NDUFA2O43678 99 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 THBS1P07996 1170 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF84P51523 738 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SELENOVP59797 346 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 IKZF1Q13422 519 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 CCDC190Q86UF4 302 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 THEM6Q8WUY1 208 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 GP6Q9HCN6 339 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF724A8MTY0 619 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 FAM157AC9JC47 383 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 G3V2T6 193 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF208O43345 1280 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 RGS10O43665 173 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 NPIPB7O75200 414 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF432O94892 652 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SRD5A1P18405 259 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 BAMBIQ13145 260 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 MPPED2Q15777 294 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZER1Q7Z7L7 766 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF440Q8IYI8 595 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 CMBLQ96DG6 245 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 BCL2L10Q9HD36 194 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 ZNF224Q9NZL3 707 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 NDUFAF4Q9P032 175 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 TMCC3Q9ULS5 477 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 RASD1Q9Y272 281 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 IGHV3-13P01766 116 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-212ENST00000548567 IGHV3-7P01780 117 aa6.45□□□□□ -1.38
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