RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531842.1

USF1-210, Transcript of upstream transcription factor 1, humanhuman

TSL 5

Gene USF1, Length 720 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1-210ENST00000531842 PHF21AQ96BD5 680 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SEH1LQ96EE3 360 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 COG8Q96MW5 612 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 WACQ9BTA9 647 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TRIM15Q9C019 465 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MMP28Q9H239 520 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ADA2Q9NZK5 511 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CD300AQ9UGN4 299 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.37□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 PRSS37A4D1T9 235 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 K7EIL1 84 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SLC16A7O60669 478 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TSPAN9O75954 239 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SERPINA1P01009 418 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CD14P08571 375 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 T-ENOLP0DO92 83 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RAC2P15153 192 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CTLA4P16410 223 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FPR3P25089 353 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GPR4P46093 362 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SRP9P49458 86 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HERPUD1Q15011 391 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZBED5Q49AG3 693 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MESTQ5EB52 335 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CORO6Q6QEF8 472 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 BTN2A1Q7KYR7 527 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CPLX4Q7Z7G2 160 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CYP4Z1Q86W10 505 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OFCC1Q8IZS5 231 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 KLHDC1Q8N7A1 406 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RORBQ92753 470 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 C7orf34Q96L11 122 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 Q96M85 177 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNF570Q96NI8 536 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FUZQ9BT04 418 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.36□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TENM2Q9NT68 2774 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 A0A087WUU8 490 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR6C6A6NF89 314 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DYNC1I1O14576 645 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CDC42EP2O14613 210 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DVL1O14640 695 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GPR37O15354 613 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 AHCYL1O43865 530 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 SELLP14151 372 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GABRA5P31644 462 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RAD23AP54725 363 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 AQP6Q13520 282 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR8B8Q15620 311 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 IFI44LQ53G44 452 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FOXB2Q5VYV0 432 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FBXW12Q6X9E4 464 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 Q6ZTK2 550 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FAM90A1Q86YD7 464 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ST8SIA4Q92187 359 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 RASD2Q96D21 266 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 NDUFAF4Q9P032 175 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 LRRC30A6NM36 301 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 IQCF6A8MYZ5 107 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 IFNL4K9M1U5 179 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 DIRAS1O95057 198 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 CD28P10747 220 aa7.34□□□□□ -1.23
USF1-210ENST00000531842 HSD17B1P14061 328 aa7.34□□□□□ -1.23
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