RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517278.1

RNU6-1174P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1174, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1174P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PTHLHP12272 177 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MUTP22033 750 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MMP11P24347 488 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PTPN6P29350 595 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FOXN2P32314 431 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CHKAP35790 457 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CCR9P51686 369 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CNN1P51911 297 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 OR4D2P58180 307 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HERVK_113P63132 956 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ERVK-8P63133 956 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ERVK-25P63136 954 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SRYQ05066 204 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SKP2Q13309 424 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PICALMQ13492 652 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ELOBQ15370 118 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 BCL2A1Q16548 175 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C4orf26Q17RF5 130 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SFT2D3Q587I9 215 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CCNJQ5T5M9 372 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NIPAL1Q6NVV3 410 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SBSNQ6UWP8 590 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KLHL7Q8IXQ5 586 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SLC22A24Q8N4F4 322 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CEP112Q8N8E3 955 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 WDR31Q8NA23 367 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PLPP5Q8NEB5 264 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 P3H4Q92791 437 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GGHQ92820 318 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 HIST1H2ACQ93077 130 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ZUFSPQ96AP4 578 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TMCO6Q96DC7 493 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SEH1LQ96EE3 360 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GLT1D1Q96MS3 346 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SLC25A23Q9BV35 468 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EDEM2Q9BV94 578 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KATNB1Q9BVA0 655 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ERVK-6Q9BXR3 956 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PECRQ9BY49 303 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ABCG4Q9H172 646 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NUDT15Q9NV35 164 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 OR5V1Q9UGF6 321 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SHPKQ9UHJ6 478 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RAB22AQ9UL26 194 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 ENTPD4Q9Y227 616 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MSH6P52701 1360 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PKD1P98161 4303 aa-1.64□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 A0A087X0K7 114 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 A0A1B0GUS0 222 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 F5H423 210 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 M0QXV9 152 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 M0R2N4 97 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CASC3O15234 703 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 NMT2O60551 498 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 UTS2O95399 124 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MT-ND4P03905 459 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CHRNGP07510 517 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 KRT16P08779 473 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TPSB2P20231 275 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RAB3AP20336 220 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CYP2B6P20813 491 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 CNTFP26441 200 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RORAP35398 523 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SMSP52788 366 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 SYNJ2BPP57105 145 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 OGDHQ02218 1023 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 GLO1Q04760 184 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PNOCQ13519 176 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PCLAFQ15004 111 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 TPSAB1Q15661 275 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 INAQ16352 499 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MOGQ16653 247 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 PARP6Q2NL67 630 aa-1.65□□□□□ -2.67
RNU6-1174P-201ENST00000517278 MAP9Q49MG5 647 aa-1.65□□□□□ -2.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms