RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 TRIML2Q8N7C3 387 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CACNG8Q8WXS5 425 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 TMIGD2Q96BF3 282 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SGTBQ96EQ0 304 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM210BQ96KR6 192 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 EDA2RQ9HAV5 297 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM49BQ9NUQ9 324 aa5.18□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SYCE1LA8MT33 242 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PAHP00439 452 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CD3GP09693 182 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CD37P11049 281 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 GFAPP14136 432 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 IVDP26440 423 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 PFN2P35080 140 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 P2RX1P51575 399 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CCR6P51684 374 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 DGCR6Q14129 220 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 METTL13Q8N6R0 699 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NOXO1Q8NFA2 376 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ADA2Q9NZK5 511 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NEU3Q9UQ49 428 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MEGF6O75095 1541 aa5.17□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM135BQ49AJ0 1406 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CNTLNQ9NXG0 1405 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ATP10BO94823 1461 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 KLLNB2CW77 178 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 M0QX08 132 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 NMT2O60551 498 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ENTPD5O75356 428 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC25A27O95847 323 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB3AP20336 220 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXA9P31269 272 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MPPED2Q15777 294 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MDS2Q8NDY4 140 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 ZFP90Q8TF47 636 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8D1Q8WZ84 308 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 SPNS1Q9H2V7 528 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 AGLP35573 1532 aa5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 EEA1Q15075 1411 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 MROH2AA6NES4 1674 aa5.15□□□□□ -1.58
PGGT1B-205ENST00000514178 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 HACD1B0YJ81 288 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF879B4DU55 563 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 HLA-DPB1P04440 258 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8U9P0C7N5 309 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PPICP45877 212 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CSNK1A1P48729 337 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 HCAR3P49019 387 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMC5P62195 406 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 OR8U1Q8NH10 309 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF170Q96K19 258 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF681Q96N22 645 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ARMC7Q9H6L4 198 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 HECW1Q76N89 1606 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MYO3AQ8NEV4 1616 aa5.15□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CLIP1P30622 1438 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 EP400Q96L91 3159 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 REREQ9P2R6 1566 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC16A7O60669 478 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PLEKHA8P1O95397 391 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PSMC3P17980 439 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ERCC8Q13216 396 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 KIR2DS1Q14954 304 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 CYB5R2Q6BCY4 276 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF175Q8N4F7 328 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 COX18Q8N8Q8 333 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 WDR31Q8NA23 367 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 OR11H7Q8NGC8 314 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 NDNFQ8TB73 568 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC20Q8TCA0 184 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 BTN2A3PQ96KV6 586 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC40A1Q9NP59 571 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 ASTN1O14525 1302 aa5.14□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 PRXQ9BXM0 1461 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 KDM5CP41229 1560 aa5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PGGT1B-205ENST00000514178 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms