RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484474.1

ERBB4-208, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 4, human

TSL 3

Gene ERBB4, Length 582 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB4-208	ENST00000484474	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	EXTL1	Q92935	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	C4orf45	Q96LM5	186 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SFXN3	Q9BWM7	321 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OR10A2	Q9H208	303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PIGM	Q9H3S5	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	OPA3	Q9H6K4	179 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	MPDZ	O75970	2070 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	ACACA	Q13085	2346 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ERBB4-208	ENST00000484474	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474		A0A1B0GVI7	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	CLDN25	C9JDP6	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474		E9PI62	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	MAGEB3	O15480	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	LRRTM2	O43300	516 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC19A2	O60779	497 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	CDRT1	O95170	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TGM6	O95932	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	LALBA	P00709	142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TPO	P07202	933 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	RAB3B	P20337	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	CDA	P32320	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SDC2	P34741	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ECI1	P42126	302 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PPP3R1	P63098	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PMP22	Q01453	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	FAP	Q12884	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	DOK3	Q7L591	496 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	FTMT	Q8N4E7	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	CEP19	Q96LK0	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	RNF121	Q9H920	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	EMC7	Q9NPA0	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	FAM206A	Q9NX38	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	CIB4	A0PJX0	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474		F5H5K5	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474		M0R135	149 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	RER1	O15258	196 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	XRCC2	O43543	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ERBB4-208	ENST00000484474	SYT7	O43581	403 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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