RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTBQ06643 244 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GUSBP1Q15486 140 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR2A2Q6IF42 318 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM219Q86XT9 240 aa7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SAMD8Q96LT4 415 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NSMCE2Q96MF7 247 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TSSK2Q96PF2 358 aa7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.24□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.24□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 AHSA1O95433 338 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HSD17B1P14061 328 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CDKN1AP38936 164 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35A1P78382 337 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MS4A2Q01362 244 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LRRC17Q8N6Y2 441 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 OR11H4Q8NGC9 324 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC35B4Q969S0 331 aa7.23□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 THTPAQ9BU02 230 aa7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SSX5O60225 188 aa7.22□□□□□ -1.25
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 HLA-DOBP13765 273 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX6B1P14854 86 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCKARP32238 428 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 P2RY4P51582 365 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MNAT1P51948 309 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3F3AP84243 136 aa7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PHLDA2Q53GA4 152 aa7.22□□□□□ -1.25
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