RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PARP11Q9NR21 331 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM140Q9NV12 185 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CALML5Q9NZT1 146 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GV50 99 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3BA6NDS4 549 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CD1AP06126 327 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 THBS1P07996 1170 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CXCL1P09341 107 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SPARCP09486 303 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3HP0C7X1 549 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMP2P13473 410 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 APLNRP35414 380 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM6P40199 344 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A9P48067 706 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF616Q08AN1 781 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZVL8 140 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM129CQ86XR2 697 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51F2Q8NH61 342 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM106AQ96A25 262 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 C5orf34Q96MH7 638 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 YPEL4Q96NS1 127 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MS4A8Q9BY19 250 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51B6Q9H340 312 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR13Q9NZ81 148 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO7Q9Y3I1 522 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 SMCO3A2RU48 225 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF432O94892 652 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGC2P03986 189 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 NPSP0C0P6 89 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FCARP24071 287 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 MC3RP41968 323 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF136P52737 540 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS12P56730 875 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 AWAT2Q6E213 333 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2T2Q6IF00 324 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR51A4Q8NGJ6 313 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52A5Q9H2C5 316 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 PRODH2Q9UF12 536 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 IL36AQ9UHA7 158 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK8Q8NF50 2099 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 USP34Q70CQ2 3546 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 LEFTY2O00292 366 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RX6O15547 441 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CD81P60033 236 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 UBE2V2Q15819 145 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM104Q8NE00 496 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GRHL3Q8TE85 626 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SMARCD2Q92925 531 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MRGPRFQ96AM1 343 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDN23Q96B33 292 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM3DQ96BQ1 224 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MUCL1Q96DR8 90 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 G6PC3Q9BUM1 346 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.52□□□□□ -1.21
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RABGEF1-203ENST00000439720 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNA9Q9UGM1 479 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ICAM5Q9UMF0 924 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FITM1A5D6W6 292 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RAMP1O60894 148 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 IL2RAP01589 272 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MAS1LP35410 378 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SNCAP37840 140 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB1AP62820 205 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GLO1Q04760 184 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1Q1Q15612 314 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 C4orf17Q53FE4 359 aa7.52□□□□□ -1.21
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