RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 G6PC3Q9BUM1 346 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TNCP24821 2201 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf74A8MZ97 194 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD1O60671 282 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RP2O75695 350 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2A2Q6IF42 318 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ARRDC1Q8N5I2 433 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC46A1Q96NT5 459 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ADOQ96SZ5 270 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SH2D2AQ9NP31 389 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPE3 182 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO24O75426 580 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGER4P35408 488 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CAV2P51636 162 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1C2P52895 323 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1C1Q04828 323 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PJVKQ0ZLH3 352 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC18B1Q6NT16 456 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC10Q8N2F6 343 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MALSU1Q96EH3 234 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT14Q96FL9 552 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CACFD1Q9UGQ2 172 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 A8MVM7 634 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A7O60669 478 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB6AP20340 208 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A1P53985 500 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC26A5P58743 744 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TERB2Q8NHR7 220 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ASB17Q8WXJ9 295 aa3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 KXD1Q9BQD3 176 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCC2Q9BRT2 126 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC26A1Q9H2B4 701 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRDM6Q9NQX0 595 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP17Q9ULZ9 603 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HHLA2Q9UM44 414 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BLACEA4D250 179 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NME1P15531 152 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 PBX2P40425 430 aa3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZSR6 202 aa3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR13G1Q8NGZ3 307 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PROK2Q9HC23 129 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SERINC1Q9NRX5 453 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ITPR1Q14643 2758 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC187A0A096LP49 1063 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LIPT2A6NK58 231 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CRYBA1P05813 215 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PSMB6P28072 239 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CCR5P51681 352 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD11B2P80365 405 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LGALS3BPQ08380 585 aa3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6N2Q8NGY6 317 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ8AQ8NI60 647 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMED6Q8WW62 240 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A15Q9H2J7 730 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TCF7L1Q9HCS4 588 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 U3KQA8 63 aa3.19□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PPC4 97 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC00587B1AMM8 73 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GOSR2O14653 212 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IGHV2-70P01814 119 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CX3CR1P49238 355 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LUZP2Q86TE4 346 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF676Q8N7Q3 588 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GATSQ8NAP1 163 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 STEAP2Q8NFT2 490 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC22AQ96IW7 307 aa3.19□□□□□ -1.9
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