RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR5B21A6NL26 309 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LGALS8O00214 317 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MT-CO2P00403 227 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PAX6P26367 422 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CNTFRP26992 372 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ELK4P28324 431 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FDFT1P37268 417 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TALDO1P37837 337 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RORCP51449 518 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TWF1Q12792 350 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CDK5R1Q15078 307 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PTPN20Q4JDL3 420 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AARDQ4LEZ3 155 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C10orf99Q6UWK7 81 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ENPP6Q6UWR7 440 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GBP6Q6ZN66 633 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC00696Q6ZRV3 163 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BBS7Q8IWZ6 715 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACOT4Q8N9L9 421 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LHFPL5Q8TAF8 219 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPACA4Q8TDM5 124 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C7orf34Q96L11 122 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM70Q9BUB7 260 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATG10Q9H0Y0 220 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ADAP2Q9NPF8 381 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NDUFB11Q9NX14 153 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CES1P1Q9UKY3 287 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SNURFQ9Y675 71 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIAA1109Q2LD37 5005 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 A0A0B4J2C4 111 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C17orf98A8MV24 154 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLDN5O00501 218 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DYNC1I1O14576 645 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FFAR1O14842 300 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GYG2O15488 501 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRATO95237 230 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CA1P00915 261 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MT-ND3P03897 115 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C2P06681 752 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD37P11049 281 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRABP2P29373 138 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEACAM3P40198 252 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AKR1C3P42330 323 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC1A2P43004 574 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GSSP48637 474 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EVX1P49640 407 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HCCSP53701 268 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NAPAP54920 295 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MESDQ14696 234 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RALBP1Q15311 655 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MEP1BQ16820 701 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TYSND1Q2T9J0 566 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HFEQ30201 348 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFI44LQ53G44 452 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRIM40Q6P9F5 258 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CD300LGQ6UXG3 332 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC16A14Q7RTX9 510 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBWD2Q8IUF1 395 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NKAIN4Q8IVV8 208 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LRRC8AQ8IWT6 810 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLDN19Q8N6F1 224 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM133AQ8N9E0 248 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR8A1Q8NGG7 326 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NANPQ8TBE9 248 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ENKURQ8TC29 256 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAIP1Q8WWC4 291 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC114Q96M63 670 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GPR22Q99680 433 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SH3GL1Q99961 368 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLF1Q9BQI6 1058 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MS4A8Q9BY19 250 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ACTR8Q9H981 624 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ANO10Q9NW15 660 aa-1.01□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms