RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411083.1

RNU6-1135P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1135, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1135P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ICOSQ9Y6W8 199 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CNTNAP1P78357 1384 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 A0A0B4J2C4 111 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ERLIN2O94905 339 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TRGV3P03979 118 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 C2P06681 752 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FBXW4P57775 412 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RPS23P62266 143 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MGAT3Q09327 533 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ECH1Q13011 328 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CASP8Q14790 479 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ARMC3Q5W041 872 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 COMTD1Q86VU5 262 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CPNE9Q8IYJ1 553 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NPWQ8N729 165 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM184AQ8NB25 1140 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHST4Q8NCG5 386 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCNS1Q96KK3 526 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ODF3Q96PU9 254 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC38A2Q96QD8 506 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FICDQ9BVA6 458 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MFFQ9GZY8 342 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PPA2Q9H2U2 334 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CWH43Q9H720 699 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM60AQ9NP50 221 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CA10Q9NS85 328 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ACOT9Q9Y305 439 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KCNE3Q9Y6H6 103 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ZNF462Q96JM2 2506 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PRRG1O14668 218 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FGGP02679 453 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CCDC192P0DO97 292 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSD17B2P37059 387 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TALDO1P37837 337 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RAB9AP51151 201 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MERTKQ12866 999 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TMEM144Q7Z5S9 345 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MDP1Q86V88 176 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PANX2Q96RD6 677 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP3A43Q9HB55 503 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CLN8Q9UBY8 286 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLIT2O94813 1529 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MYOFQ9NZM1 2061 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RGSL1A5PLK6 1076 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FNDC10F2Z333 226 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GOSR2O14653 212 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KRT13P13646 458 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GGT1P19440 569 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MUTP22033 750 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYP2F1P24903 491 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CFHR2P36980 270 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GAMTQ14353 236 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 PDK1Q15118 436 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TPRXLQ17RH7 258 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TCAIMQ8N3R3 496 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SLC25A29Q8N8R3 303 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MFSD9Q8NBP5 474 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR10G6Q8NH81 332 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MTMR9Q96QG7 549 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OR4K3Q96R72 315 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 OMDQ99983 421 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 SMOXQ9NWM0 555 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ING4Q9UNL4 249 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ALPK2Q86TB3 2170 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 LCTP09848 1927 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 RTTNQ86VV8 2226 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 ODF3BA8MYP8 253 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 IGLL5B9A064 214 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MAS1P04201 325 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GRIA1P42261 906 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TAS2R46P59540 309 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 GPR107Q5VW38 600 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 UQCC3Q6UW78 93 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 CYHR1Q6ZMK1 362 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 TICAM2Q86XR7 235 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 KDM8Q8N371 416 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-1135P-201ENST00000411083 MUC15Q8N387 334 aa-0.93□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms