RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 RYR2Q92736 4967 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 XKRYO14609 159 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 AHCYL1O43865 530 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 IGLL1P15814 213 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RPL4P36578 427 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB121Q5J5C9 76 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CORO6Q6QEF8 472 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAM122BQ7Z309 247 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 NRMQ8IXM6 262 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 GJC3Q8NFK1 279 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF14Q92956 283 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SSX3Q99909 188 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 HDHD2Q9H0R4 259 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SYT4Q9H2B2 425 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 BAG5Q9UL15 447 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.74■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 BIRC6Q9NR09 4857 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 HTR3EA5X5Y0 456 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 EFCAB9A8MZ26 197 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 GRPP07492 148 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CD14P08571 375 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ACSM4P0C7M7 580 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC9A3P48764 834 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ST3GAL3Q11203 375 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 KCNMB1Q16558 191 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MEP1BQ16820 701 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 TEX36Q5VZQ5 186 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PGAP1Q75T13 922 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 BEND2Q8NDZ0 799 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 C17orf50Q8WW18 174 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CLPTM1LQ96KA5 538 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF570Q96NI8 536 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCL13Q99616 98 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 A4GNTQ9UNA3 340 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 POLR1DQ9Y2S0 133 aa15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MEGF11A6BM72 1044 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 F5H5K5 113 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FBXO24O75426 580 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 LHBP01229 141 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PRKCDQ05655 676 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ANKDD1AQ495B1 522 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CMTM4Q8IZR5 234 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 DPP10Q8N608 796 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RORBQ92753 470 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 OR4F4Q96R69 305 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC28BQ9BUN5 200 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFAF1Q9Y375 327 aa15.72■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 GMDSO60547 372 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 LCATP04180 440 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC18A1P54219 525 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 MALLQ13021 153 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 WDR38Q5JTN6 314 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 FAM216BQ8N7L0 139 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 SLC22A4Q9H015 551 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 NUAK2Q9H093 628 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 ADA2Q9NZK5 511 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 RHCGQ9UBD6 479 aa15.71■□□□□ 0.11
HOXD12-201ENST00000404162 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 A6NLC8 198 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CD300LBA8K4G0 201 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CDC42EP2O14613 210 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 PAX6P26367 422 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 UBE2E1P51965 193 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 PRRC1Q96M27 445 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 DMRTB1Q96MA1 342 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 DCTN5Q9BTE1 182 aa15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 PPP1R3DO95685 299 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CD33P20138 364 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 GPR4P46093 362 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 YAP1P46937 504 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CENPAP49450 140 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 ACSM1Q08AH1 577 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 NFYCQ13952 458 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 ZBED5Q49AG3 693 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 PGBD2Q6P3X8 592 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP77Q6ZQR2 320 aa15.69■□□□□ 0.1
HOXD12-201ENST00000404162 PTCHD4Q6ZW05 846 aa15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms