RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 ORAI1Q96D31 301 aa6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 VN1R1Q9GZP7 353 aa6.08□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 COL6A3P12111 3177 aa6.08□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 C9JQL5 133 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 SAT1P21673 171 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZBTB25P24278 435 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 AWAT1Q58HT5 328 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 SEMG1P04279 462 aa6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 CTGFP29279 349 aa6.07□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
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RABGEF1-202ENST00000380828 NSDHLQ15738 373 aa6.07□□□□□ -1.44
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