RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 IGLV3-1P01715 115 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LCATP04180 440 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF9P0C862 333 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MPGP29372 298 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 DDOSTP39656 456 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TPTEP56180 551 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ECH1Q13011 328 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 STK11Q15831 433 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RGS21Q2M5E4 152 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00303Q3SY05 128 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SLC36A2Q495M3 483 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TFAP2EQ6VUC0 442 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR1K1Q8NGR3 316 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR14K1Q8NGZ2 314 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 GLRX2Q9NS18 164 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CKLFQ9UBR5 152 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ADAM30Q9UKF2 790 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PRR14LQ5THK1 2151 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 NCOR2Q9Y618 2525 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TOXO94900 526 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TPOP07202 933 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CSF3P09919 207 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FSTP19883 344 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CCL1P22362 96 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ID4P47928 161 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RAB1AP62820 205 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TSC22D1Q15714 1073 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 C3P1Q6ZMU1 363 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 DCDC5Q6ZRR9 648 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 IZUMO1Q8IYV9 350 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR51D1Q8NGF3 324 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR52N4Q8NGI2 321 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 B3GNT2Q9NY97 397 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.38□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PR80 420 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 APOA1P02647 267 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CCNOP22674 350 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-2P23083 117 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PSMD7P51665 324 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TAB1Q15750 504 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 C2orf76Q3KRA6 126 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 GLYATL3Q5SZD4 288 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 DRAM2Q6UX65 266 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 DOK3Q7L591 496 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR1M1Q8NGA1 313 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR13C9Q8NGT0 318 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A28Q96A46 364 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A38Q96DW6 304 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ABHD1Q96SE0 405 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CCDC32Q9BV29 185 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.37□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 A0A0U1RQV5 110 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SLC34A2O95436 690 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 APOC1P02654 83 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CD37P11049 281 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 IL7P13232 177 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF12P17014 697 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF20P17024 532 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FAM166AQ6J272 317 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FAM180AQ6UWF9 173 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZNX1 250 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CD163Q86VB7 1156 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 POC5Q8NA72 575 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CHPT1Q8WUD6 406 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SPACA5Q96QH8 159 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FAM215AQ9Y5M1 114 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PQ09 198 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LYZL6O75951 148 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CALCBP10092 127 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 BDKRB2P30411 391 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 EFNB2P52799 333 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2NLQ5JXB2 153 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 GLT8D1Q68CQ7 371 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF529Q6P280 563 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD16Q6P6B7 361 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LYPD6Q86Y78 171 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF584Q8IVC4 421 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 Q8N402 240 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 JAGN1Q8N5M9 183 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 GDPD1Q8N9F7 314 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SYNPRQ8TBG9 265 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR10A2Q9H208 303 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D24Q9ULP9 559 aa13.36□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 C5orf49A4QMS7 147 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SLC17A2O00624 439 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RAD51DO75771 328 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TNFSF13O75888 250 aa13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms