RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 PRELID1Q9Y255 219 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 POLR1DQ9Y2S0 133 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MEGF11A6BM72 1044 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MPTX1A8MV57 137 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 E9PLN8 166 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 C3orf80F5H4A9 247 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SULT2B1O00204 365 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 RER1O15258 196 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 HEXBP07686 556 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF20P17024 532 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 IGFBP4P22692 258 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 HSD11B1P28845 292 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SFTPDP35247 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SERPINF1P36955 418 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 CASRP41180 1078 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 STARP49675 285 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 NPY4RP50391 375 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MMP16P51512 607 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 EMP2P54851 167 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 CLRN1P58418 232 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 IL13RA1P78552 427 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ZP4Q12836 540 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 BAMBIQ13145 260 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MYBPHQ13203 477 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MEF2DQ14814 521 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 PCK2Q16822 640 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 CLVS2Q5SYC1 327 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 POC1BQ8TC44 478 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 WNT2BQ93097 391 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 DDIT4LQ96D03 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ASF1BQ9NVP2 202 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 TAS2R3Q9NYW6 316 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 COMMD9Q9P000 198 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ADAMTS20P59510 1910 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 C5orf51A6NDU8 294 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 GDF9O60383 454 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ADAP1O75689 374 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 GIMD1P0DJR0 217 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 RAB3AP20336 220 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 RAB6AP20340 208 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MICBQ29980 383 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LCN10Q6JVE6 187 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 DTX1Q86Y01 620 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR5AS1Q8N127 324 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ARMC10Q8N2F6 343 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR8B12Q8NGG6 310 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR4K15Q8NH41 348 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ST8SIA1Q92185 356 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 EDAQ92838 391 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC46Q96FV0 321 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR5B2Q96R09 309 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 PRRT1Q99946 306 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 GPR84Q9NQS5 396 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 FRYLO94915 3013 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0B4J2A0 478 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 A0A0D9SG52 128 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 EFSO43281 561 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR2J2O76002 312 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 OR2F2O95006 317 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 HTR3BO95264 441 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 BPNT1O95861 308 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 IL2RAP01589 272 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRR-202ENST00000342084 IFNA6P05013 189 aa6.43□□□□□ -1.38
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