RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF20P17024 532 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ATF1P18846 271 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ELK1P19419 428 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 AGTR1P30556 359 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 THBS2P35442 1172 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CAPZA1P52907 286 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SCAND1P57086 179 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PSG4Q00888 419 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PLP2Q04941 152 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SCN1BQ07699 218 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 IL18Q14116 193 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF774Q6NX45 483 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM53Q6P2H8 277 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM180AQ6UWF9 173 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 PGAP1Q75T13 922 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 FGD2Q7Z6J4 655 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRTM1Q86UE6 522 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 C12orf49Q9H741 205 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ATPIF1Q9UII2 106 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAJC13O75165 2243 aa8.84□□□□□ -0.99
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GTI1 187 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PAHP00439 452 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PDGFAP04085 211 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LCATP04180 440 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A1P11166 492 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 HTR5AP47898 357 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PITPNBP48739 271 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PER3P56645 1201 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PITPNAQ00169 270 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM16LQ309B1 348 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 HES5Q5TA89 166 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OR8B12Q8NGG6 310 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf40Q8WUR7 153 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 EXTL1Q92935 676 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C10orf35Q96D05 121 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR137Q96N19 417 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SOSTQ9BQB4 213 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RGCCQ9H4X1 137 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR84Q9NQS5 396 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MALT1Q9UDY8 824 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ETV7Q9Y603 341 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 V9GYH0 126 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 APC2O95996 2303 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ACACAQ13085 2346 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A096LPE4 126 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1W2PPZ6 126 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EM74 188 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGEB3O15480 346 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR1O75083 606 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CRHP06850 196 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PATE4P0C8F1 98 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 COX5BP10606 129 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ADRA2CP18825 462 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3AP20336 220 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL1P22362 96 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYGSP22914 178 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 BDKRB2P30411 391 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 DDOSTP39656 456 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NR4A2P43354 598 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ID4P47928 161 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 ART1P52961 327 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB1AP62820 205 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB11BQ15907 218 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 UBE2NLQ5JXB2 153 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE4AQ5TA78 99 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf135Q5VTT2 229 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 PRSS45Q7RTY3 260 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N402 240 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 GFI1Q99684 422 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 SRRQ9GZT4 340 aa8.83□□□□□ -1
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms