RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264010.8

CTCF-201, Transcript of CCCTC-binding factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCF, Length 3,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCF-201ENST00000264010 FAM186AA6NE01 2351 aa14.59□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 BDKRB2P30411 391 aa14.59□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FHL1Q13642 323 aa14.59□□□□□ -0.07
CTCF-201ENST00000264010 COL19A1Q14993 1142 aa14.59□□□□□ -0.07
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CTCF-201ENST00000264010 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.57□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 TSPAN15O95858 294 aa14.57□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 DEGS2Q6QHC5 323 aa14.57□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 OR1J4Q8NGS1 313 aa14.57□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 ELP5Q8TE02 316 aa14.57□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 C11orf40Q8WZ69 217 aa14.56□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 A0A1B0GUH1 482 aa14.56□□□□□ -0.08
CTCF-201ENST00000264010 A0A1B0GV90 55 aa14.56□□□□□ -0.08
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CTCF-201ENST00000264010 MST1P26927 711 aa14.56□□□□□ -0.08
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