RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF343Q6P1L6 599 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BHQ93079 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BNQ99877 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST1H2BMQ99879 126 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RAMP1O60894 148 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SLC35G6P0C7Q6 338 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FSTP19883 344 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CRABP1P29762 137 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 UNC119Q13432 240 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CCINQ13939 588 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 GPBAR1Q8TDU6 330 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.97■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 THSD7BQ9C0I4 1608 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HSPB2A8KAH6 182 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 K7EPK0 472 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FKTNO75072 461 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 C1QL1O75973 258 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF708P17019 499 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TMEM33P57088 247 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 IL15RAQ13261 267 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 DHCR24Q15392 516 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HSPB2Q16082 182 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 NNATQ16517 81 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 MED25Q71SY5 747 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 HIST3H2BBQ8N257 126 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 OR13C3Q8NGS6 347 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 DNAJA3Q96EY1 480 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 LPAR4Q99677 370 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 PPP1R2P9O14990 202 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CXCL1P09341 107 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 CD37P11049 281 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 RAB22AQ9UL26 194 aa18.96■□□□□ 0.63
ODC1-201ENST00000234111 ZNF587BE7ETH6 402 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RENP00797 406 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CSTAP01040 98 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 SPARCP09486 303 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CLDN6P56747 220 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 FAM3AP98173 230 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 PTX4Q96A99 478 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CYYR1Q96J86 154 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CNTD2Q9H8S5 307 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 IGLON5A6NGN9 336 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 K7EQS6 105 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 SLC2A1P11166 492 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 FABP4P15090 132 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CAMLGP49069 296 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 UCP2P55851 309 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 KIF26BQ2KJY2 2108 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CACUL1Q86Y37 369 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 COMMD1Q8N668 190 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa18.95■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 ZNF264O43296 627 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 C1orf100Q5SVJ3 147 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 MARCH3Q86UD3 253 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 Q8WTZ3 238 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 WASF3Q9UPY6 502 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CCL16O15467 120 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RABIFP47224 123 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 ADPRHP54922 357 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RELQ04864 619 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 LCN9Q8WX39 176 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa18.94■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 MEGF11A6BM72 1044 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 OR5H15A6NDH6 313 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 OR5H1A6NKK0 313 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 COX5BP10606 129 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 C5AR1P21730 350 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 HSD11B2P80365 405 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 ENPP2Q13822 863 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 TCEA2Q15560 299 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP18.93■□□□□ 0.627e-8■■■□□ 15.9
ODC1-201ENST00000234111 CATSPERDQ86XM0 798 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 GATSQ8NAP1 163 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 AVL9Q8NBF6 648 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RSC1A1Q92681 617 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 ERGIC1Q969X5 290 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 MMP25Q9NPA2 562 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 CUTCQ9NTM9 273 aa18.93■□□□□ 0.62
ODC1-201ENST00000234111 COL4A6Q14031 1691 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms