RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF583Q96ND8 569 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SMURF2Q9HAU4 748 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 TMCC3Q9ULS5 477 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HIF3AQ9Y2N7 669 aa13.42□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FCN3O75636 299 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ABHD16AO95870 558 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 PSME3P61289 254 aa13.41□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 ERICH5Q6P6B1 374 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa13.41□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 ATG16L2Q8NAA4 619 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HAVCR1Q96D42 359 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CDRT15Q96T59 188 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 ECSITQ9BQ95 431 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 DCLRE1BQ9H816 532 aa13.41□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 MED31Q9Y3C7 131 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MAB21L2Q9Y586 359 aa13.41□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 MLNRO43193 412 aa13.4□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC35A2P78381 396 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 FHL1Q13642 323 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 DMRTC1Q5HYR2 192 aa13.4□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 RNF144BQ7Z419 303 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 OR5AS1Q8N127 324 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 CLDN22Q8N7P3 220 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC75AQ8NAA5 344 aa13.4□□□□□ -0.26
SPCS1-201ENST00000233025 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 SH3GL1Q99961 368 aa13.4□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 TUBG2Q9NRH3 451 aa13.4□□□□□ -0.26
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SPCS1-201ENST00000233025 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
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SPCS1-201ENST00000233025 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
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SPCS1-201ENST00000233025 PGM2L1Q6PCE3 622 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ARL9Q6T311 187 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NSMAFQ92636 917 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ALG12Q9BV10 488 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SPAG4Q9NPE6 437 aa13.39□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.39□□□□□ -0.27
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SPCS1-201ENST00000233025 F5H5P2 479 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NPFFO15130 113 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FKBP6O75344 327 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ACTR3P61158 418 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RPL27P61353 136 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ARPINQ7Z6K5 226 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 Q8TCH9 128 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 STARD10Q9Y365 291 aa13.38□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 FFAR1O14842 300 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PAHP00439 452 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IFNA14P01570 189 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 NR2C1P13056 603 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 IFI30P13284 250 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 RAC2P15153 192 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SAA4P35542 130 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ST3GAL3Q11203 375 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 LY6EQ16553 131 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SGCAQ16586 387 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 SPATS1Q496A3 300 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.37□□□□□ -0.27
SPCS1-201ENST00000233025 BTN2A1Q7KYR7 527 aa13.37□□□□□ -0.27
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