RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 MYL9P24844 172 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TPRA1Q86W33 373 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC54Q8NEL0 328 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 OR8B12Q8NGG6 310 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R14AQ96A00 147 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 PGAM5Q96HS1 289 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 DERL3Q96Q80 235 aa27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 CD2P06729 351 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF12P17014 697 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 BMP5P22003 454 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM57BQ71RH2 274 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF391Q9UJN7 358 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 COL6A6A6NMZ7 2263 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 USP24Q9UPU5 2620 aa27.02■■□□□ 1.92
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 DBHP09172 617 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CALRP27797 417 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX6P35712 828 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ODF4Q2M2E3 257 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 LUZP2Q86TE4 346 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RDH10Q8IZV5 341 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC7A6Q92536 515 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 DACH2Q96NX9 599 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10A2Q9H208 303 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC24A3Q9HC58 644 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ELOVL5Q9NYP7 299 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 DHDHQ9UQ10 334 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 AMDHD2Q9Y303 409 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CDRT1O95170 752 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA5P05154 406 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 STOMP27105 288 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SDC2P34741 201 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B12Q53GQ0 312 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 MDP1Q86V88 176 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF75AQ96N20 296 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 NOX3Q9HBY0 568 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 JKAMPQ9P055 326 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 PCNX1Q96RV3 2341 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GVI7 797 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A1P11166 492 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL1P22362 96 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 IL32P24001 234 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 APEX1P27695 318 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS19P39019 145 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ASB5Q8WWX0 329 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM106AQ96A25 262 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OSGIN2Q9Y236 505 aa27■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5H1A6NKK0 313 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CASKO14936 926 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV3-1P01715 115 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 APLNRP35414 380 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 STAC2Q6ZMT1 411 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM169BQ8N8A8 192 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51A4Q8NGJ6 313 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR10AC1Q8NH08 325 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A46Q96AG3 418 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 POM121L2Q96KW2 1035 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNS3Q9BQ31 491 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 NOX4Q9NPH5 578 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 A3GALT2U3KPV4 340 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA1BQ00975 2339 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 P2RY10O00398 339 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SYT7O43581 403 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CBR1P16152 277 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RORCP51449 518 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM23BQ5SRD1 257 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM27D1Q5T7N8 215 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 DOK3Q7L591 496 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 NAA40Q86UY6 237 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF584Q8IVC4 421 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR31Q8NA23 367 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SLITRK2Q9H156 845 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 RGCCQ9H4X1 137 aa26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 COLCA1Q6ZS62 124 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CROCCP3Q8IVE0 287 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 STEAP2Q8NFT2 490 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1J2Q8NGS2 313 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 OR51E1Q8TCB6 317 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ITFG2Q969R8 447 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 SNTG1Q9NSN8 517 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF319Q9P2F9 582 aa26.97■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC100509620A0A075B734 347 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1B0GTI1 187 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 CCL21O00585 134 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 LCATP04180 440 aa26.96■■□□□ 1.91
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
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